RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484483.1

PTP4A2-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2, human

TSL 2

Gene PTP4A2, Length 651 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTP4A2-205	ENST00000484483	OMP	P47874	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	CSNK1A1	P48729	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	SLC9A3	P48764	834 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	NR1H2	P55055	460 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	CTXN1	P60606	82 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	PRPS1	P60891	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	CBX1	P83916	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	SPIB	Q01892	262 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	FHL1	Q13642	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	PPA1	Q15181	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	TAF11	Q15544	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	ACKR1	Q16570	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZBED5	Q49AG3	693 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	SPATA24	Q86W54	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	TMEM123	Q8N131	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	TMEM54	Q969K7	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	GPA33	Q99795	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	TACC2	O95359	2948 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	APC	P25054	2843 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483		A0A1W2PPR1	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483		A0A1W2PR80	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	DHRS12	A0PJE2	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	CENPBD1	B2RD01	187 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	EBAG9	O00559	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	DHH	O43323	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR10H3	O60404	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	NDUFB2	O95178	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	GAST	P01350	101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	CD14	P08571	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	CELA3B	P08861	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	QDPR	P09417	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	PAX7	P23759	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF83	P51522	516 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	CLRN1	P58418	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	ERVK-25	P63136	954 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	FLOT2	Q14254	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	MELK	Q14680	651 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	HIST3H3	Q16695	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	RFX4	Q33E94	735 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	ASRGL1	Q7L266	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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