RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479596.5

CCNL1-222, Transcript of cyclin L1, human

TSL 3

Gene CCNL1, Length 883 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNL1-222	ENST00000479596	RNF121	Q9H920	327 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CCNL1-222	ENST00000479596	SIAE	Q9HAT2	523 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CCNL1-222	ENST00000479596	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CCNL1-222	ENST00000479596	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CCNL1-222	ENST00000479596	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CCNL1-222	ENST00000479596	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	NDUFAB1	O14561	156 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	LYNX1	P0DP58	116 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	ZNF23	P17027	643 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	ZNF32	P17041	273 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	LSP1	P33241	339 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	GPR4	P46093	362 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	SLC9A3	P48764	834 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	CTXN1	P60606	82 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	CD47	Q08722	323 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	RIN1	Q13671	783 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	OAF	Q86UD1	273 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	OR51B6	Q9H340	312 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	C1orf198	Q9H425	327 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	TMEM160	Q9NX00	188 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	LRP5L	A4QPB2	252 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596		H7C1C5	153 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	LILRA1	O75019	489 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	CLPTM1	O96005	669 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	HPX	P02790	462 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	TACSTD2	P09758	323 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	ZNF250	P15622	560 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	IL2RG	P31785	369 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	LIMS1	P48059	325 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	GZMK	P49863	264 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	GYS2	P54840	703 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	LCN6	P62502	163 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	THEM4	Q5T1C6	240 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	RNF148	Q8N7C7	305 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	C7orf34	Q96L11	122 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	CDH20	Q9HBT6	801 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	DUSP13	Q9UII6	198 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596		A0A1W2PRQ8	180 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	NCR1	O76036	304 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	SEMG1	P04279	462 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	SCG5	P05408	212 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	NAT2	P11245	290 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	IGFBP5	P24593	272 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	WNT5A	P41221	380 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	UCP2	P55851	309 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	ERVK-25	P63136	954 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	DGCR6	Q14129	220 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	SEC23B	Q15437	767 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	TRIP10	Q15642	601 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	SGCA	Q16586	387 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	MEST	Q5EB52	335 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	FAM27B	Q5VT28	67 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	GLYAT	Q6IB77	296 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	FAM122B	Q7Z309	247 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	FUZ	Q9BT04	418 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CCNL1-222	ENST00000479596		A0A1W2PPW3	197 aa		12.86	□□□□□ -0.35

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