RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 C1orf100Q5SVJ3 147 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2W3Q7Z3T1 314 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC8AQ8IWT6 810 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM9CQ8IZT9 166 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10R2Q8NGX6 335 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 OR9G1Q8NH87 305 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 CT45A3Q8NHU0 189 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 MRGPRFQ96AM1 343 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 BBS2Q9BXC9 721 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 CTPS2Q9NRF8 586 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 GGA2Q9UJY4 613 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 MOB4Q9Y3A3 225 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 E7EWF7 191 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 H7C423 109 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 MPDU1O75352 247 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 VAPBO95292 243 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 FOLR1P15328 257 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 IVDP26440 423 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 HTR2BP41595 481 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 UCNP55089 124 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 TPM4P67936 248 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 MS4A2Q01362 244 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC63Q05C16 580 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 PTPN20Q4JDL3 420 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 PAGE2BQ5JRK9 111 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF621Q6ZSS3 439 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM150AQ86TG1 271 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM252Q8N6L7 170 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10H4Q8NGA5 316 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ITFG1Q8TB96 612 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ACER1Q8TDN7 264 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 BAALCQ8WXS3 180 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 PIK3IP1Q96FE7 263 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 TSG101Q99816 390 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 C19orf24Q9BVV8 132 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 Q9H3A6 140 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLPH3Q9H4A6 298 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKHQ9HCJ1 492 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 STMN3Q9NZ72 180 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF581Q9P0T4 197 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 BTNL2Q9UIR0 455 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMB11A5LHX3 300 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF726A6NNF4 738 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 SMKR1H3BMG3 65 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ZG16O60844 167 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ICOSLGO75144 302 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 TDP2O95551 362 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 SEMG1P04279 462 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 HTR2CP28335 458 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 IL12BP29460 328 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 DLX1P56177 255 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 CLDN6P56747 220 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 CSNK1G2P78368 415 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 TWF1Q12792 350 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 CLEC6AQ6EIG7 209 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 C6orf89Q6UWU4 347 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF620Q6ZNG0 422 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 MOB1BQ7L9L4 216 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 SYS1Q8N2H4 156 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF2BQ8N4N8 673 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 VN1R2Q8NFZ6 395 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 SDR42E1Q8WUS8 393 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 FOXN4Q96NZ1 517 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 FOXC2Q99958 501 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 LZTS2Q9BRK4 669 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.672e-11■■■■□ 24.4
RABGGTB-209ENST00000473406 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0G2JLM5 398 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 PRSS44E7EML9 344 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 H3BN98 237 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 DPM1O60762 260 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 SNAPINO95295 136 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKHA8P1O95397 391 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV3-48P01763 117 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ARG1P05089 322 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 TPM3P06753 285 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 TACSTD2P09758 323 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 PRPS2P11908 318 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 NQO2P16083 231 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMC3P17980 439 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ZP3P21754 424 aa4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms