RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468534.1

CCDC88A-210, Transcript of coiled-coil domain containing 88A, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC88A, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC88A-210ENST00000468534 FGF21Q9NSA1 209 aa4.16□□□□□ -1.74
CCDC88A-210ENST00000468534 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
CCDC88A-210ENST00000468534 STARD5Q9NSY2 213 aa4.16□□□□□ -1.74
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CCDC88A-210ENST00000468534 C8orf88P0DMB2 117 aa4.15□□□□□ -1.75
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CCDC88A-210ENST00000468534 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa4.15□□□□□ -1.75
CCDC88A-210ENST00000468534 KIF26BQ2KJY2 2108 aa4.15□□□□□ -1.75
CCDC88A-210ENST00000468534 ARHGEF10O15013 1369 aa4.14□□□□□ -1.75
CCDC88A-210ENST00000468534 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa4.14□□□□□ -1.75
CCDC88A-210ENST00000468534 A0A0A6YYD5 115 aa4.14□□□□□ -1.75
CCDC88A-210ENST00000468534 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa4.14□□□□□ -1.75
CCDC88A-210ENST00000468534 OR2M5A3KFT3 312 aa4.14□□□□□ -1.75
CCDC88A-210ENST00000468534 TVP23AA6NH52 213 aa4.14□□□□□ -1.75
CCDC88A-210ENST00000468534 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa4.14□□□□□ -1.75
CCDC88A-210ENST00000468534 J3QLI3 93 aa4.14□□□□□ -1.75
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