RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 CDH20Q9HBT6 801 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 A0A087WUU8 490 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 A6NIZ1 184 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 FFAR1O14842 300 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 AHCYL1O43865 530 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF682O95780 498 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 TGFAP01135 160 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 IGHMP01871 453 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 MAKP20794 623 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 ACHEP22303 614 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 COL8A2P25067 703 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 APLNRP35414 380 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 GSK3BP49841 420 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 SLC7A2P52569 658 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 SEC24CP53992 1094 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 RAP1BP61224 184 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 RAP1AP62834 184 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 HSF2Q03933 536 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 CD47Q08722 323 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 SGCAQ16586 387 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 SYT9Q86SS6 491 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 OAFQ86UD1 273 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 OFCC1Q8IZS5 231 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 LRRC18Q8N456 261 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 OR51A7Q8NH64 312 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 C1orf159Q96HA4 380 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 SYT3Q9BQG1 590 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 TPK1Q9H3S4 243 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 CHODLQ9H9P2 273 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 ENPP4Q9Y6X5 453 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 STAB1Q9NY15 2570 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PPW3 197 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 LRP5LA4QPB2 252 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 C17orf100A8MU93 164 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 J3KTA2 159 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 NME4O00746 187 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 PTP4A3O75365 173 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 GMNNO75496 209 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 PRSS23O95084 383 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 SLC2A10O95528 541 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 CLPTM1O96005 669 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 SERPINA1P01009 418 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 IGHV3-13P01766 116 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 HPXP02790 462 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 MT-ND5P03915 603 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 LCKP06239 509 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 CD14P08571 375 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 CST2P09228 141 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 FAM157BP0CG42 384 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 LYNX1P0DP58 116 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 CCL2P13500 99 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF32P17041 273 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 RHCEP18577 417 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 HNF1AP20823 631 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 STOMP27105 288 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 PRDX6P30041 224 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 CDAP32320 146 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 ALDH3B1P43353 468 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 GDI2P50395 445 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 PSME3P61289 254 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 PCBD1P61457 104 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 TEKQ02763 1124 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 FHL1Q13642 323 aa6.24□□□□□ -1.41
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