RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 RNF121Q9H920 327 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 SH3BP4Q9P0V3 963 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 NTMQ9P121 344 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 A0A1W2PPR1 153 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 A0A1W2PQD3 144 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 LINC00587B1AMM8 73 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 ADAMDEC1O15204 470 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 HSMCR30P0CW71 290 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 FAM27E3Q08E93 113 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 TP53BP2Q13625 1128 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 TATDN3Q17R31 274 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 RUNDC3AQ59EK9 446 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 RAET1LQ5VY80 246 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 OR4F3Q6IEY1 312 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 AHSA2Q719I0 299 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 ADGRG3Q86Y34 549 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 SLC30A8Q8IWU4 369 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 OR2T12Q8NG77 320 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 GPR151Q8TDV0 419 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 LINC00052Q96N35 136 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 FBXL2Q9UKC9 423 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 DSCAMO60469 2012 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 OR2M5A3KFT3 312 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 SIAH2O43255 324 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 FAM20BO75063 409 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 CST1P01037 141 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 EPHA2P29317 976 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 RPL35P42766 123 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 P2RY6Q15077 328 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 TUSC1Q2TAM9 212 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 FAM71E1Q6IPT2 247 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 DLEU7Q6UYE1 221 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 TFAP2EQ6VUC0 442 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 NPSR1Q6W5P4 371 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF621Q6ZSS3 439 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 OR4A15Q8NGL6 344 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 UFD1Q92890 307 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 FAM162AQ96A26 154 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 SRRQ9GZT4 340 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 SLC22A4Q9H015 551 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 SHARPINQ9H0F6 387 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 MPDZO75970 2070 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 ELOVL7A1L3X0 281 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 OVOL3O00110 214 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 PLA2G10O15496 165 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 WBP4O75554 376 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 GBAP04062 536 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 THBS1P07996 1170 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 IL3P08700 152 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 RRASP10301 218 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 CCKARP32238 428 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 KCNJ5P48544 419 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 ALDH9A1P49189 494 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 PSG6Q00889 435 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 ASAH1Q13510 395 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 PDE7AQ13946 482 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 LAPTM4AQ15012 233 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 LTB4RQ15722 352 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 TIGD6Q17RP2 521 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 FDX2Q6P4F2 183 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 VWA1Q6PCB0 445 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 LAX1Q8IWV1 398 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 TIGD4Q8IY51 512 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC36Q8IYA8 594 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 GCNT2Q8N0V5 402 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 SLC43A2Q8N370 569 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 PRR18Q8N4B5 295 aa5.35□□□□□ -1.55
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