RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 TMEM71Q6P5X7 295 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 CADM4Q8NFZ8 388 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 DCUN1D4Q92564 292 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 FGGYQ96C11 551 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 SMIM19Q96E16 107 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF806P0C7X5 589 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 DLSTP36957 453 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 CYB561P49447 251 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 EMDP50402 254 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 FZD2Q14332 565 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 CDK5R1Q15078 307 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 ESX1Q8N693 406 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 H7C2Y5 167 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 PIAS2O75928 621 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 ATG12O94817 140 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 SPDEFO95238 335 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 GZMKP49863 264 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 TAS2R46P59540 309 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 PGAP1Q75T13 922 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 EMC6Q9BV81 110 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 CDCP1Q9H5V8 836 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 ELK1P19419 428 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 ACHEP22303 614 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 EVI2BP34910 448 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 TNK1Q13470 666 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 ZIC1Q15915 447 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 ESCO2Q56NI9 601 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 MOB3CQ70IA8 216 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 CALCBP10092 127 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 RRADP55042 308 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 EHFQ9NZC4 300 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 PARP14Q460N5 1801 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 OR2W5A6NFC9 320 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 RGS13O14921 159 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 FCGR2AP12318 317 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 GCH1P30793 250 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 HCCSP53701 268 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 CASP6P55212 293 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 BTG1P62324 171 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 CLVS2Q5SYC1 327 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 ELP2Q6IA86 826 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 IFI44Q8TCB0 444 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 MED18Q9BUE0 208 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 RAB22AQ9UL26 194 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf172-201ENST00000436881 ZGLP1P0C6A0 271 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 EVX1P49640 407 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 FBLIM1Q8WUP2 373 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ZG16BQ96DA0 208 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 TSSK2Q96PF2 358 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 PCM1Q15154 2024 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 A0A087WUJ7 227 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 HSPB2A8KAH6 182 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 GABARAPH6UMI1 98 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 SERPINE2P07093 398 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 CDK5Q00535 292 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF616Q08AN1 781 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ECH1Q13011 328 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ZMYND11Q15326 602 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 HSPB2Q16082 182 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 Q6ZTK2 550 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 OR4K15Q8NH41 348 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 CD300LFQ8TDQ1 290 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 LRRC46Q96FV0 321 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 RAC2P15153 192 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 CPT2P23786 658 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 IFITM2Q01629 132 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms