RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACSM4P0C7M7 580 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 P0C879 139 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GKN3PP0CG01 181 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC26A3P40879 764 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACTA2P62736 377 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACTG2P63267 376 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACTC1P68032 377 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACTA1P68133 377 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF33AQ06730 810 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TCP10Q12799 353 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM83EQ2M2I3 478 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCNJQ5T5M9 372 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRELID2Q8N945 189 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GATSQ8NAP1 163 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR13C9Q8NGT0 318 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR2A1Q8NGT9 310 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR10R2Q8NGX6 335 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR2G3Q8NGZ4 309 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PIH1D2Q8WWB5 315 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SERPINB12Q96P63 405 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 P2RX4Q99571 388 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR11A1Q9GZK7 315 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLEC4EQ9ULY5 219 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FLVCR2Q9UPI3 526 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CDH10Q9Y6N8 788 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PIK3R4Q99570 1358 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 THSD7BQ9C0I4 1608 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CENPXA8MT69 81 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MMP23AO75900 390 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LSM8O95777 96 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TGM6O95932 706 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 APOA1P02647 267 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLTAP09496 248 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CSF3P09919 207 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MGMTP16455 207 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GPR1P46091 355 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RORCP51449 518 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCR8P51685 355 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SP4Q02446 784 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IRF8Q02556 426 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RNF165Q6ZSG1 346 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR5B3Q8NH48 314 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FANK1Q8TC84 345 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MRAPQ8TCY5 172 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C7orf33Q8WU49 177 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MARC2Q969Z3 335 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ASB9Q96DX5 294 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR5B12Q96R08 314 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FBXO44Q9H4M3 255 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM9Q9P0T7 183 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DDX19BQ9UMR2 479 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MOKQ9UQ07 419 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A0J9YXY3 114 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TSPAN11A1L157 253 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EPOPA6NHQ4 379 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PSMD11O00231 422 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NVLO15381 856 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FKBP6O75344 327 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HBE1P02100 147 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SMIM10L1P0DMW3 83 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF250P15622 560 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 F2RP25116 425 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RGRP47804 291 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 APOC4P55056 127 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AQP6Q13520 282 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 Q3ZCU0 254 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LRRC10Q5BKY1 277 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZBED8Q8IZ13 594 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PNKDQ8N490 385 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZADH2Q8N4Q0 377 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCDC54Q8NEL0 328 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR52E5Q8NH55 327 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MCOLN3Q8TDD5 553 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MYDGFQ969H8 173 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SMIM10Q96HG1 83 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CALN1Q9BXU9 219 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TM6SF2Q9BZW4 377 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DEFB127Q9H1M4 99 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLN6Q9NWW5 311 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLCF1Q9UBD9 225 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CFAP45Q9UL16 551 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM168BA1KXE4 195 aa3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms