RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 CHPT1Q8WUD6 406 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 ESAMQ96AP7 390 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 S100PBPQ96BU1 408 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 FAHD2AQ96GK7 314 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 C7orf34Q96L11 122 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SFXN2Q96NB2 322 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 FAM210AQ96ND0 272 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRK-211ENST00000429595 NODALQ96S42 347 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 MBOAT4Q96T53 435 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 PKP4Q99569 1192 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 DHRS9Q9BPW9 319 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRK-211ENST00000429595 GABARAPL3Q9BY60 117 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRK-211ENST00000429595 PCBD2Q9H0N5 130 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 IKZF5Q9H5V7 419 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRK-211ENST00000429595 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRK-211ENST00000429595 ENPP5Q9UJA9 477 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 BAG5Q9UL15 447 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 PPIAL4AQ9Y536 164 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SNX5Q9Y5X3 404 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 KCNE2Q9Y6J6 123 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 NCKAP5O14513 1909 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 NPIPA7E9PJI5 369 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SLC1A7O00341 560 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 ADAMDEC1O15204 470 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 HCRTR2O43614 444 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
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PTPRK-211ENST00000429595 TPST1O60507 370 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 CTNSO60931 367 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 CBR3O75828 277 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 GABARAPO95166 117 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRK-211ENST00000429595 SLC16A8O95907 504 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SERPINA1P01009 418 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 FABP3P05413 133 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 NPIPA8P0DM63 369 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 ERGP11308 486 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRK-211ENST00000429595 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SOX2P48431 317 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRK-211ENST00000429595 PHEXP78562 749 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 HMGCS1Q01581 520 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRK-211ENST00000429595 CHIT1Q13231 466 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 RUNX2Q13950 521 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 NTRK2Q16620 822 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 PAGE2BQ5JRK9 111 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRK-211ENST00000429595 SLC22A25Q6T423 547 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 CYP4Z1Q86W10 505 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 PTOV1Q86YD1 416 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 CA13Q8N1Q1 262 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 PARP8Q8N3A8 854 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF321PQ8N8H1 164 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 ZDHHC22Q8N966 263 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SMYD1Q8NB12 490 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 C7orf57Q8NEG2 295 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 OR6K3Q8NGY3 331 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 FAM110BQ8TC76 370 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 ZFP90Q8TF47 636 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 FIG4Q92562 907 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 YIPF6Q96EC8 236 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM41AQ96HV5 264 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 PLEKHA8Q96JA3 519 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 SLC6A7Q99884 636 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 BPESC1Q9GZL8 116 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 METTL7AQ9H8H3 244 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 TPT1P8Q9HAU6 139 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 FKBP14Q9NWM8 211 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 ADPRHL2Q9NX46 363 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 TAS2R10Q9NYW0 307 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-211ENST00000429595 AHSPQ9NZD4 102 aa5.35□□□□□ -1.55
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