RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 RAD52P43351 418 aa17.81■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 UCP2P55851 309 aa17.81■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 SELENOVP59797 346 aa17.81■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 ERVS71-1P61550 626 aa17.81■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 ST3GAL3Q11203 375 aa17.81■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 NKPD1Q17RQ9 610 aa17.81■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 MICU2Q8IYU8 434 aa17.81■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 SYNPRQ8TBG9 265 aa17.81■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 C19orf24Q9BVV8 132 aa17.81■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 LRMDAQ9H2I8 198 aa17.81■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa17.81■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 TAAR3PQ9P1P4 343 aa17.81■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa17.8■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 LOC100653049A0A140TA62 436 aa17.8■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 PIP5K1CO60331 668 aa17.8■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 KRT34O76011 436 aa17.8■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 MAGEB1P43366 347 aa17.8■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 SELENOWP63302 87 aa17.8■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 PCGF3Q3KNV8 242 aa17.8■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 ALG10Q5BKT4 473 aa17.8■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 LRRC18Q8N456 261 aa17.8■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 RFLNBQ8N5W9 214 aa17.8■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 C11orf40Q8WZ69 217 aa17.8■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 TSPAN32Q96QS1 320 aa17.8■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 ALG12Q9BV10 488 aa17.8■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 CAPN7Q9Y6W3 813 aa17.8■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 ELOVL7A1L3X0 281 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 LCKP06239 509 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 CDAP32320 146 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 APLNRP35414 380 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 HSF2Q03933 536 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 FMODQ06828 376 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 LAPTM4AQ15012 233 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 GLCCI1Q86VQ1 547 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 OFCC1Q8IZS5 231 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 FNDC8Q8TC99 324 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 SNX33Q8WV41 574 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 BPIFA2Q96DR5 249 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 KCNN2Q9H2S1 579 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 OR51B6Q9H340 312 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC134Q9H6E4 229 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 AP3M1Q9Y2T2 418 aa17.79■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 WNT9BO14905 357 aa17.78■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 ICMTO60725 284 aa17.78■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 IGHV3-13P01766 116 aa17.78■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF32P17041 273 aa17.78■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 STOMP27105 288 aa17.78■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 CD47Q08722 323 aa17.78■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 ALKBH6Q3KRA9 238 aa17.78■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 FAM27BQ5VT28 67 aa17.78■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 FAM205BPQ63HN1 556 aa17.78■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM154Q6P9G4 183 aa17.78■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa17.78■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 ARPINQ7Z6K5 226 aa17.78■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 LRRC75AQ8NAA5 344 aa17.78■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 LZICQ8WZA0 190 aa17.78■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 TPD52L3Q96J77 140 aa17.78■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 POM121L2Q96KW2 1035 aa17.78■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa17.78■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 CMTM6Q9NX76 183 aa17.78■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 FAM157AC9JC47 383 aa17.77■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 MSMBP08118 114 aa17.77■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 GAAP10253 952 aa17.77■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 IFI30P13284 250 aa17.77■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 FUT4P22083 530 aa17.77■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 IFNA8P32881 189 aa17.77■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 RPL27P61353 136 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 LMO4P61968 165 aa17.77■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 FHL1Q13642 323 aa17.77■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 MOGQ16653 247 aa17.77■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 ANKDD1AQ495B1 522 aa17.77■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 THEM4Q5T1C6 240 aa17.77■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 LIPNQ5VXI9 398 aa17.77■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF101Q8IZC7 436 aa17.77■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 FAM156AQ8NDB6 213 aa17.77■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 RCN3Q96D15 328 aa17.77■□□□□ 0.44
UBXN4-204ENST00000426921 PPIHO43447 177 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
UBXN4-204ENST00000426921 MAKP20794 623 aa17.76■□□□□ 0.43
UBXN4-204ENST00000426921 SRP14P37108 136 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
UBXN4-204ENST00000426921 WNT5AP41221 380 aa17.76■□□□□ 0.43
UBXN4-204ENST00000426921 CRYBB2P43320 205 aa17.76■□□□□ 0.43
UBXN4-204ENST00000426921 CCL8P80075 99 aa17.76■□□□□ 0.43
UBXN4-204ENST00000426921 PSG4Q00888 419 aa17.76■□□□□ 0.43
UBXN4-204ENST00000426921 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP17.76■□□□□ 0.43
UBXN4-204ENST00000426921 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
UBXN4-204ENST00000426921 VTCN1Q7Z7D3 282 aa17.76■□□□□ 0.43
UBXN4-204ENST00000426921 NRMQ8IXM6 262 aa17.76■□□□□ 0.43
UBXN4-204ENST00000426921 SLC15A3Q8IY34 581 aa17.76■□□□□ 0.43
UBXN4-204ENST00000426921 OR1J1Q8NGS3 322 aa17.76■□□□□ 0.43
UBXN4-204ENST00000426921 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
UBXN4-204ENST00000426921 NSMAFQ92636 917 aa17.76■□□□□ 0.43
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM186Q96B77 213 aa17.76■□□□□ 0.43
UBXN4-204ENST00000426921 NARFLQ9H6Q4 476 aa17.76■□□□□ 0.43
UBXN4-204ENST00000426921 HIF1ANQ9NWT6 349 aa17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms