RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 VEGFBP49765 207 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 BTG2P78543 158 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FGL1Q08830 312 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFB115Q30KQ5 88 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FIGLAQ6QHK4 219 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMPPEQ6ZT21 453 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DPY19L4Q7Z388 723 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 C7orf57Q8NEG2 295 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51S1Q8NGJ8 323 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NXPE2Q96DL1 559 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 AIFM2Q9BRQ8 373 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10A4Q9H209 315 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF319Q9P2F9 582 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MAB21L2Q9Y586 359 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PRR14LQ5THK1 2151 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SPTBN2O15020 2390 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CPED1A4D0V7 1026 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RIIAD1A6NNX1 92 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LGALS8O00214 317 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TO15178 435 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GIMD1P0DJR0 217 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PAX6P26367 422 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PPIAP62937 165 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MDGA2Q7Z553 956 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 D2HGDHQ8N465 521 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ST8SIA2Q92186 375 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPA12BQ96MM6 686 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MRI1Q9BV20 369 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF208Q9H0X6 261 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SYT4Q9H2B2 425 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC1BQ9P126 229 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 B3GAT1Q9P2W7 334 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 KLK13Q9UKR3 277 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A13Q9Y226 551 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MGAQ8IWI9 3026 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LMX1BO60663 402 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT33AO76009 404 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR7A10O76100 309 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FCGR3AP08637 254 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MYOGP15173 224 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RORAP35398 523 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB38P57729 211 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PON3Q15166 354 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMUB2Q71RG4 321 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LDLRAD3Q86YD5 345 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GABRG1Q8N1C3 465 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM89BQ8N5H3 189 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CAMKVQ8NCB2 501 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5AP2Q8NGF4 316 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC20Q8TCA0 184 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ARV1Q9H2C2 271 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 UBQLN2Q9UHD9 624 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 WDPCPO95876 746 aa3.25□□□□□ -1.89
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PGGT1B-203ENST00000419445 GRM7Q14831 915 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 BCORP1Q8N888 145 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MYADMQ96S97 322 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TLNRD1Q9H1K6 362 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LIME1Q9H400 295 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHB10Q9UN67 800 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMED7Q9Y3B3 224 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF175Q9Y473 711 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 COL6A3P12111 3177 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 POM121CA8CG34 1229 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR31O00270 319 aa3.25□□□□□ -1.89
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PGGT1B-203ENST00000419445 ISG15P05161 165 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 XPAP23025 273 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF117Q03924 483 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 BTN1A1Q13410 526 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 AVL9Q8NBF6 648 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM104Q8NE00 496 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC26A10Q8NG04 563 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52R1Q8NGF1 315 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RDH8Q9NYR8 311 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF224Q9NZL3 707 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FREM1Q5H8C1 2179 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF98A6NK75 572 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPB2A8KAH6 182 aa3.24□□□□□ -1.89
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