RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 SMARCD3Q6STE5 483 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF584Q8IVC4 421 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF570Q96NI8 536 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ARID1AO14497 2285 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC22A23A1A5C7 686 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 H7C1C5 153 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 AHCYL1O43865 530 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV4-39P01824 125 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 NR4A1P22736 598 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 FPR3P25089 353 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 LCN6P62502 163 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 DAG1Q14118 895 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB35Q15286 201 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 ADIPOQQ15848 244 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 RFX4Q33E94 735 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 MESTQ5EB52 335 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM27BQ5VT28 67 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR139Q6DWJ6 353 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PGM2L1Q6PCE3 622 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 NABP1Q96AH0 204 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 BDH2Q9BUT1 245 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM15Q9C019 465 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SPEF1Q9Y4P9 236 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PRSS37A4D1T9 235 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM64A6NGJ6 449 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM64BA6NI03 449 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SDHAP31040 664 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 GSSP48637 474 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 RPS6KA3P51812 740 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 BNIP1Q12981 228 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 ETFDHQ16134 617 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 CLEC12BQ2HXU8 276 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT80Q6KB66 452 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PGBD2Q6P3X8 592 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 OR4C15Q8NGM1 316 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 RASD2Q96D21 266 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 C18orf12Q96KH6 178 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF442Q9H7R0 627 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 B9A039 149 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 TXNDC12O95881 172 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PTHP01270 115 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 RAP2AP10114 183 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PLP2Q04941 152 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 TSPAN31Q12999 210 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2T5Q6IEZ7 315 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00471Q8N535 108 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2T29Q8NH02 315 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 CHID1Q9BWS9 393 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 OR52D1Q9H346 318 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PPL8 197 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 AQP12BA6NM10 295 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 H7C1Q1 480 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 H7C417 338 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SOCS2O14508 198 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 GSC2O15499 205 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 CCNB2O95067 398 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 GASTP01350 101 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 APEHP13798 732 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 LAP3P28838 519 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 GALK2Q01415 458 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 EFNB3Q15768 340 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 AQP12AQ8IXF9 295 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC30A7Q8NEW0 376 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 FANK1Q8TC84 345 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SAMD8Q96LT4 415 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 IMPA2O14732 288 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SSX4O60224 188 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R3DO95685 299 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SCG5P05408 212 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 CST2P09228 141 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 INHBBP09529 407 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 CCL2P13500 99 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF32P17041 273 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC6A6P31641 620 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 HSF2Q03933 536 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 TNK1Q13470 666 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 ADGRG5Q8IZF4 528 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-204ENST00000416021 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
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