RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412272.6

HERC4-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 4,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-205ENST00000412272 CORTO00230 105 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 AGPAT2O15120 278 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 CILPO75339 1184 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 ICAM1P05362 532 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 C8AP07357 584 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 NR2F6P10588 404 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 DGKAP23743 735 aa4.75□□□□□ -1.65
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HERC4-205ENST00000412272 GABRA4P48169 554 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 JAG1P78504 1218 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 UBE2V2Q15819 145 aa4.75□□□□□ -1.65
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HERC4-205ENST00000412272 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 SPATA46Q5T0L3 261 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 IL34Q6ZMJ4 242 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 FAM220AQ7Z4H9 259 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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HERC4-205ENST00000412272 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 OR10R2Q8NGX6 335 aa4.75□□□□□ -1.65
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HERC4-205ENST00000412272 ZNF75AQ96N20 296 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 OR5B2Q96R09 309 aa4.75□□□□□ -1.65
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HERC4-205ENST00000412272 RAD18Q9NS91 495 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 B4GALT6Q9UBX8 382 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 FTSJ1Q9UET6 329 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 MSRB2Q9Y3D2 182 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 ATP23Q9Y6H3 246 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 H3BN98 237 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 K7ERU9 68 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 ADAM20O43506 726 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 DFFBO76075 338 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 SOD1P00441 154 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 RLN1P04808 185 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 CD14P08571 375 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 FAHP16930 419 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 SDC1P18827 310 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 NPY4RP50391 375 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 MMP15P51511 669 aa4.75□□□□□ -1.65
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HERC4-205ENST00000412272 DLK1P80370 383 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 BDH1Q02338 343 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 PJVKQ0ZLH3 352 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 ZNF345Q14585 488 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 VMACQ2NL98 169 aa4.75□□□□□ -1.65
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HERC4-205ENST00000412272 MORN2Q502X0 79 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 C6orf136Q5SQH8 315 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 GPR157Q5UAW9 335 aa4.75□□□□□ -1.65
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HERC4-205ENST00000412272 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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HERC4-205ENST00000412272 EFNB1P98172 346 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 CACNG1Q06432 222 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC4-205ENST00000412272 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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HERC4-205ENST00000412272 PRSS8Q16651 343 aa4.75□□□□□ -1.65
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