RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 CLRN1P58418 232 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 SIRPAP78324 504 aa8.73□□□□□ -1.01
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POLR1A-202ENST00000409024 STK11Q15831 433 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 KCNMB1Q16558 191 aa8.73□□□□□ -1.01
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POLR1A-202ENST00000409024 ZNF684Q5T5D7 378 aa8.73□□□□□ -1.01
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POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa8.73□□□□□ -1.01
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POLR1A-202ENST00000409024 FAM220AQ7Z4H9 259 aa8.73□□□□□ -1.01
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POLR1A-202ENST00000409024 RPS4Y2Q8TD47 263 aa8.73□□□□□ -1.01
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POLR1A-202ENST00000409024 TTYH2Q9BSA4 534 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 OR51E2Q9H255 320 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 KCNN2Q9H2S1 579 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.73□□□□□ -1.01
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POLR1A-202ENST00000409024 OR6C65A6NJZ3 312 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 H7C1C5 153 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 J3QLW9 94 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 KLK10O43240 276 aa8.72□□□□□ -1.01
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POLR1A-202ENST00000409024 CYTIPO60759 359 aa8.72□□□□□ -1.01
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POLR1A-202ENST00000409024 CLPXO76031 633 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 IL1AP01583 271 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 HLA-DQA2P01906 255 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 KRT8P05787 483 aa8.72□□□□□ -1.01
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POLR1A-202ENST00000409024 CTLA4P16410 223 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF823P16415 610 aa8.72□□□□□ -1.01
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POLR1A-202ENST00000409024 LHX2P50458 406 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 OR12D2P58182 307 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 VBP1P61758 197 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 NCS1P62166 190 aa8.72□□□□□ -1.01
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POLR1A-202ENST00000409024 ROM1Q03395 351 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 RUNX1T1Q06455 604 aa8.72□□□□□ -1.01
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POLR1A-202ENST00000409024 C10orf128Q5T292 105 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 FDX2Q6P4F2 183 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 GPAT4Q86UL3 456 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 ZADH2Q8N4Q0 377 aa8.72□□□□□ -1.01
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POLR1A-202ENST00000409024 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 OR9K2Q8NGE7 335 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 OR51L1Q8NGJ5 315 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 OR6N2Q8NGY6 317 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 OR10D3Q8NH80 312 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 NEIL3Q8TAT5 605 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM54Q969K7 222 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM45BQ96B21 275 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 TXNDC15Q96J42 360 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 KCTD7Q96MP8 289 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 TBX5Q99593 518 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 WACQ9BTA9 647 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 GP6Q9HCN6 339 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 MED29Q9NX70 200 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 C2CD3Q4AC94 2353 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GVC2 190 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
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