RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDH4P55283 916 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDC20Q12834 499 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL24Q13007 206 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHIT1Q13231 466 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAB21L1Q13394 359 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIR2DS1Q14954 304 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKDD1AQ495B1 522 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHYHD1Q5SRE7 291 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAET1LQ5VY80 246 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 UQCC3Q6UW78 93 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 KDM7AQ6ZMT4 941 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 HDDC2Q7Z4H3 204 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 OAFQ86UD1 273 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00304Q8N9R0 145 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 NOXO1Q8NFA2 376 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCFD1Q8WVM8 642 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSKH2Q96QS6 385 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 P2RX4Q99571 388 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 DOK1Q99704 481 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF5Q99942 180 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 SULT4A1Q9BR01 284 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRACR2AQ9BSW2 395 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A2Q9BXI2 301 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM59Q9BXS4 323 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 VCX2Q9H322 139 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIGLQ9Y2B2 252 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 S4R3C0 116 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP10AO60312 1499 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNTNA6NMZ2 147 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDRT1O95170 752 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB3DO95716 219 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSPAN12O95859 305 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARFIP1P53367 373 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBE2HP62256 183 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMUG1Q53HV7 270 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 PMF1Q6P1K2 205 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRMT9Q6P2P2 845 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 BRD3OSQ6XYD6 125 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRP11Q86VZ4 500 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CALHM1Q8IU99 346 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 GATSQ8NAP1 163 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 NECAP1Q8NC96 275 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLEKHA8Q96JA3 519 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 SH3GL1Q99961 368 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC39A3Q9BRY0 314 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 UVRAGQ9P2Y5 699 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTSFQ9UBX1 484 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTPRTO14522 1441 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 A8MUU9 505 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOX15O60248 233 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1orf105O95561 183 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL1BP01584 269 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAS1LP35410 378 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEACAM6P40199 344 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 VHLP40337 213 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 OPRK1P41145 380 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPS15P42566 896 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDKN1BP46527 198 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 AIF1P55008 147 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXW4P57775 412 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACTR1AP61163 376 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 IRF4Q15306 451 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEX43Q6ZNM6 134 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRSS58Q8IYP2 241 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 BHLHE23Q8NDY6 225 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 COQ8AQ8NI60 647 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 C15orf40Q8WUR7 153 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 STMN2Q93045 179 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIK3IP1Q96FE7 263 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFT74Q96LB3 600 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF681Q96N22 645 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAMK2N2Q96S95 79 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 FMO2Q99518 471 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCHPQ9BT92 498 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 NT5C3AQ9H0P0 336 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD19PQ9H560 264 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 SGK2Q9HBY8 427 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXTL2Q9UBQ6 330 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC4AQ9UMR7 237 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1B0GVL5 298 aa1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms