RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ABHD16AO95870 558 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SOD1P00441 154 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 RPS27P42677 84 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 TAS2R20P59543 309 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 WDR88Q6ZMY6 472 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 KMT5CQ86Y97 462 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ZNF679Q8IYX0 411 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 OR2L13Q8N349 312 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SIRT6Q8N6T7 355 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 TMEM185AQ8NFB2 350 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 STK35Q8TDR2 534 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 PIGTQ969N2 578 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SMIM3Q9BZL3 60 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 C20orf85Q9H1P6 137 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 EMC7Q9NPA0 242 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 GPATCH2Q9NW75 528 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 A0A1W2PNR3 127 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 CD53P19397 219 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 HTR4Q13639 388 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ANGPTL5Q86XS5 388 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 GPR32P1Q8NGA4 272 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ST8SIA1Q92185 356 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ATAD5Q96QE3 1844 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 PLSCR5A0PG75 271 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 TRIM64A6NGJ6 449 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 CD300LBA8K4G0 201 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 PMPCAQ10713 525 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 CLVS2Q5SYC1 327 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 C12orf73Q69YU5 71 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 AGAP14A8MT82 685 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 RAF1P04049 648 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ZGLP1P0C6A0 271 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 CPT2P23786 658 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SEC22AQ96IW7 307 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 BRWD3Q6RI45 1802 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ASAH1Q13510 395 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SYT9Q86SS6 491 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 MAFIPQ8WZ33 124 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ARL5BQ96KC2 179 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 B3GNT2Q9NY97 397 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ZNF814B7Z6K7 855 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 CALCBP10092 127 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 GDPD3Q7L5L3 318 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 RNF128Q8TEB7 428 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 FBXL2Q9UKC9 423 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ZNF587BE7ETH6 402 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 AGPAT2O15120 278 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 TGM4P49221 684 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SMIM19Q96E16 107 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 TAS2R4Q9NYW5 299 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 BOLA1Q9Y3E2 137 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 SLC22A23A1A5C7 686 aa18.89■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 CDK5R1Q15078 307 aa18.89■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 CTF1Q16619 201 aa18.89■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa18.89■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 COQ3Q9NZJ6 369 aa18.89■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 OR14J1Q9UGF5 321 aa18.89■□□□□ 0.62
NISCH-201ENST00000345716 ANKRD61A6NGH8 418 aa18.89■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 ITGB2P05107 769 aa18.89■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 TMEM71Q6P5X7 295 aa18.89■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 CORO6Q6QEF8 472 aa18.89■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 TMEM92Q6UXU6 159 aa18.89■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 SLC34A2O95436 690 aa18.89■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 NME1P15531 152 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 GPR85P60893 370 aa18.89■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 RDH10Q8IZV5 341 aa18.89■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 OR2A5Q96R48 311 aa18.89■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 PRAMEF4O60810 478 aa18.89■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 MZT1Q08AG7 82 aa18.89■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 IKZF1Q13422 519 aa18.89■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 SLC7A6Q92536 515 aa18.89■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 BET1O15155 118 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 SLAMF6Q96DU3 332 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 SLAMF7Q9NQ25 335 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 MCRIP1C9JLW8 97 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 GABARAPH6UMI1 98 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 VAMP5O95183 116 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 QDPRP09417 244 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 FZD2Q14332 565 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 OPCMLQ14982 345 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 SNX18Q96RF0 628 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 SEC22CQ9BRL7 303 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 PRSS37A4D1T9 235 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 SMLR1H3BR10 107 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 OR10A3P58181 314 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 RPS18P62269 152 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms