RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318561.7

SFTPC-201, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFTPC, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-201ENST00000318561 IFT27Q9BW83 186 aa14.77□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa14.77□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 EGLN3Q9H6Z9 239 aa14.77□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 TMEM38BQ9NVV0 291 aa14.77□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 A0A1W2PPR1 153 aa14.76□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SOCS2O14508 198 aa14.76□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 IMPA2O14732 288 aa14.76□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 ARPC3O15145 178 aa14.76□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 CAPZA2P47755 286 aa14.76□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 BSPH1Q075Z2 132 aa14.76□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 COX10Q12887 443 aa14.76□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.76□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 CD300LDQ6UXZ3 194 aa14.76□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 ADCK1Q86TW2 530 aa14.76□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 CLDN22Q8N7P3 220 aa14.76□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 NSMAFQ92636 917 aa14.76□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 NRBF2Q96F24 287 aa14.76□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa14.76□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 NTN4Q9HB63 628 aa14.76□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 IL20Q9NYY1 176 aa14.76□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 RNF115Q9Y4L5 304 aa14.76□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 ANK2Q01484 3957 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SLC22A23A1A5C7 686 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 PRSS37A4D1T9 235 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 H7C1C5 153 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 IDH3BO43837 385 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 OR8G3PP0DMU2 310 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 ANXA8P13928 327 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 CD53P19397 219 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 PTAFRP25105 342 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 LCN6P62502 163 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 Q5PR19 223 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 HS3ST5Q8IZT8 346 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 OR5K1Q8NHB7 308 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 Q96MF0 132 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 BDH2Q9BUT1 245 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF556Q9HAH1 456 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 ZANQ9Y493 2812 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SOX14O95416 240 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 PLAUP00749 431 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 HLA-HP01893 362 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 CD79AP11912 226 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 CBR1P16152 277 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 CD40P25942 277 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 NOS3P29474 1203 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 NRN1LQ496H8 165 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 ZFP1Q6P2D0 407 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 PTCHD4Q6ZW05 846 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 AMIGO2Q86SJ2 522 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 JAZF1Q86VZ6 243 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 FAM169BQ8N8A8 192 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 OR8D4Q8NGM9 314 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 PYDC1Q8WXC3 89 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 LRTOMTQ8WZ04 291 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SLC38A2Q96QD8 506 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 TSSK6Q9BXA6 273 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa14.74□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 BHLHE40O14503 412 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 ABCD4O14678 606 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 MGRN1O60291 552 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 UBL3O95164 117 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 NPR2P20594 1047 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 PRKACGP22612 351 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 CDAP32320 146 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 ARR3P36575 388 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 GSG1Q2KHT4 349 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 C3orf36Q3SXR2 165 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 ADAM5Q6NVV9 412 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 MDP1Q86V88 176 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SKA3Q8IX90 412 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 TEX47Q8TBZ9 253 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 HTRA1Q92743 480 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SH3GL3Q99963 347 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SYT4Q9H2B2 425 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms