RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291547.9

PKNOX1-201, Transcript of PBX/knotted 1 homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKNOX1, Length 5,003 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX1-201ENST00000291547 OR8G2PQ6IF36 304 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 LRRTM3Q86VH5 581 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 OR52I1Q8NGK6 324 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 EMC9Q9Y3B6 208 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 OR2A25A4D2G3 310 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 TMEM235A6NFC5 223 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 TIMP1P01033 207 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 AOAHP28039 575 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 CTGFP29279 349 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 HTR1FP30939 366 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 TAF9Q16594 264 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 CNTN4Q8IWV2 1026 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 TMEM130Q8N3G9 435 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF511Q8NB15 262 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 WDR76Q9H967 626 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 CLEC2DQ9UHP7 191 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 MUTYHQ9UIF7 546 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 SMCHD1A6NHR9 2005 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 ENSAO43768 121 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 CLEC3BP05452 202 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 METTL15P1P0C7V9 234 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 ARSAP15289 507 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 PTAFRP25105 342 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 FOLR3P41439 243 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 HSD17B7P56937 341 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 FOXK2Q01167 660 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 TMED6Q8WW62 240 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 PTP4A1Q93096 173 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 LINC00597Q9H2U6 94 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PKNOX1-201ENST00000291547 TMEM200CA6NKL6 621 aa9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 PRAMEF4O60810 478 aa9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 GLSO94925 669 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 AIFM1O95831 613 aa9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 ARG2P78540 354 aa9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 RUNX2Q13950 521 aa9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 USP51Q70EK9 711 aa9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 DPPA4Q7L190 304 aa9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 BADQ92934 168 aa9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 SMIM14Q96QK8 99 aa9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 GINS3Q9BRX5 216 aa9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 DYNLRB1Q9NP97 96 aa9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 SLC22A11Q9NSA0 550 aa9.9□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 UMAD1C9J7I0 102 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 NME2P1O60361 137 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 C1orf105O95561 183 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 EDN3P14138 238 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 PIGAP37287 484 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 MEP1BQ16820 701 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 PLAC9Q5JTB6 97 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 MAVSQ7Z434 540 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 FAM185AQ8N0U4 392 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 PHYHIPQ92561 330 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 GPR160Q9UJ42 338 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 SRPK3Q9UPE1 567 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 PIAS3Q9Y6X2 628 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 BLACEA4D250 179 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 FITM1A5D6W6 292 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 SLC31A2O15432 143 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 ST8SIA3O43173 380 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 SIGLEC6O43699 453 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 MBP02144 154 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 GIPP09681 153 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 ERV3-1Q14264 604 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 FAM26DQ5JW98 314 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 FGGYQ96C11 551 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 RAB22AQ9UL26 194 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 PSME4Q14997 1843 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 A0A0B4J203 849 aa9.89□□□□□ -0.83
PKNOX1-201ENST00000291547 GABARAPH6UMI1 98 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms