RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 SRMP19623 302 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 LIPNQ5VXI9 398 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 HIPK2Q9H2X6 1198 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 CRLF2Q9HC73 371 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 C4orf47A7E2U8 309 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 SPINT2O43291 252 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 ANGPTL5Q86XS5 388 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 MRGPRX4Q96LA9 322 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 ASH2LQ9UBL3 628 aa18.5■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 MBTPS2O43462 519 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 RGS11O94810 467 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 TSPAN12O95859 305 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 SELEP16581 610 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 POC1BQ8TC44 478 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 STK35Q8TDR2 534 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 TSSK2Q96PF2 358 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 CMC2Q9NRP2 79 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 I6L893 689 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 AGPAT2O15120 278 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 IL3RAP26951 378 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 SERGEFQ9UGK8 458 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 ZNF728P0DKX0 622 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 MPLP40238 635 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 RNF4P78317 190 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 THEM4Q5T1C6 240 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 UBE2FQ969M7 185 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 RTL8AQ9BWD3 113 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 C1orf123Q9NWV4 160 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 TUSC2O75896 110 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 TCTN3Q6NUS6 607 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 GDPD3Q7L5L3 318 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 COMMD7Q86VX2 200 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 GFOD1Q9NXC2 390 aa18.49■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 E9PI62 339 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 CISD3P0C7P0 127 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 KITLGP21583 273 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 TBXA2RP21731 343 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 FAPQ12884 760 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 EDDM3AQ14507 147 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 KRBOX4Q5JUW0 171 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 ZNF529Q6P280 563 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 GIMAP1Q8WWP7 306 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 PSD2Q9BQI7 771 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 HEXAP06865 529 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 S100A7P31151 101 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 CLN3Q13286 438 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 LRFN5Q96NI6 719 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 RAP2BP61225 183 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 SRPXP78539 464 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 FOXC1Q12948 553 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 TTC9Q92623 222 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 TIMD4Q96H15 378 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 SLC22A11Q9NSA0 550 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 MSTNO14793 375 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 CLDN15P56746 228 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 KCNJ16Q9NPI9 418 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 A0A1W2PS29 197 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 ZNF254O75437 659 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 GUSBP08236 651 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 SPI1P17947 270 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 ZNF546Q86UE3 836 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 OR5AS1Q8N127 324 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 EXD3Q8N9H8 876 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 SLAMF6Q96DU3 332 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 ZNF195O14628 629 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 PTAFRP25105 342 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 GALEQ14376 348 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 SPNS2Q8IVW8 549 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 OXGR1Q96P68 337 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 TMEM129A0AVI4 362 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 A8MXE2 369 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 RAB5BP61020 215 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 FAM26EQ8N5C1 309 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 SPNS1Q9H2V7 528 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 GALNT9Q9HCQ5 603 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-202ENST00000285681 ACSM1Q08AH1 577 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms