RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 PPT1P50897 306 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SLC9A3R2Q15599 337 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 PLPP7Q8NBV4 271 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 KCNJ16Q9NPI9 418 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 MED6O75586 246 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 RAB6AP20340 208 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF595Q8IYB9 648 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 FBXW5Q969U6 566 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 COX14Q96I36 57 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 PBDC1Q9BVG4 233 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SMIM3Q9BZL3 60 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SLC25A32Q9H2D1 315 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 PLPP2O43688 288 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 HOXB5P09067 269 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 ACHEP22303 614 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 PGAP1Q75T13 922 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 FAM174AQ8TBP5 190 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 GIMAP5Q96F15 307 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 PISDQ9UG56 409 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 GLCEO94923 617 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 HPXP02790 462 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 THBS1P07996 1170 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SELENOPP49908 381 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 RPS15P62841 145 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SPIN3Q5JUX0 258 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 RHOUQ7L0Q8 258 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SCMH1Q96GD3 660 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 GABRG3Q99928 467 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 LRRC61Q9BV99 259 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 A0A0A6YYH2 397 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 OR5H14A6NHG9 310 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 A6NJ64 397 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SSX5O60225 188 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 OR8U9P0C7N5 309 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 APEHP13798 732 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 P2RX1P51575 399 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 GLO1Q04760 184 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 PDZK1IP1Q13113 114 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 OR1F2PQ96R84 312 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 DKKL1Q9UK85 242 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 FITM1A5D6W6 292 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 HTR3BO95264 441 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 CD1CP29017 333 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 MPEG1Q2M385 716 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 GLYATL3Q5SZD4 288 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 RAET1LQ5VY80 246 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 FAM71CQ8NEG0 241 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 TCEAL7Q9BRU2 100 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF649Q9BS31 505 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 ACKR4Q9NPB9 350 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 MOKQ9UQ07 419 aa15.6■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 PRSS44E7EML9 344 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF749O43361 778 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 TPPPO94811 219 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 CD14P08571 375 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SFTPDP35247 375 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 DIO1P49895 249 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 BTG2P78543 158 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 DUSP8Q13202 625 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 Q5BKY6 102 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 VWA2Q5GFL6 755 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SFRP5Q5T4F7 317 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 OR10A5Q9H207 317 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 PLA1AQ53H76 456 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 CARD17Q5XLA6 110 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF687Q8N1G0 1237 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 OR4C16Q8NGL9 310 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 LHFPL5Q8TAF8 219 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 PTDSS2Q9BVG9 487 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1W2PQF6 199 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 CD3DP04234 171 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 GLP1RP43220 463 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 RUNX2Q13950 521 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM200AQ86VY9 491 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 GPA33Q99795 319 aa15.59■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SULT4A1Q9BR01 284 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 167.8 ms