RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 IL6P05231 212 aa13.76□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 B4GALT1P15291 398 aa13.76□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 CRISP3P54108 245 aa13.76□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 DSTNP60981 165 aa13.76□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 RAB1AP62820 205 aa13.76□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 GLO1Q04760 184 aa13.76□□□□□ -0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 OR52B2Q96RD2 323 aa13.76□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa13.76□□□□□ -0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 CALML5Q9NZT1 146 aa13.75□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 FBXL3Q9UKT7 428 aa13.75□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 M0R3G1 203 aa13.74□□□□□ -0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 MFSD13AQ14CX5 517 aa13.74□□□□□ -0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 C1orf140Q5VVS0 124 aa13.74□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 Q6ZSV7 163 aa13.74□□□□□ -0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 OR51B6Q9H340 312 aa13.74□□□□□ -0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 SSMEM1Q8WWF3 244 aa13.73□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 C11orf40Q8WZ69 217 aa13.73□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 SGCDQ92629 289 aa13.73□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 GTF2H4Q92759 462 aa13.73□□□□□ -0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 A0A096LPI6 279 aa13.72□□□□□ -0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 DHHO43323 396 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 SPRY3O43610 288 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 FUT4P22083 530 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 MMP15P51511 669 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 COPZ1P61923 177 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 HOXC5Q00444 222 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 CAMK2DQ13557 499 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 RGNQ15493 299 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 COMTD1Q86VU5 262 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 C20orf196Q8IYI0 205 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 SLC30A7Q8NEW0 376 aa13.72□□□□□ -0.21
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