RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895		Q9Y3F1	56 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CKAP5	Q14008	2032 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	AQP7	O14520	342 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF823	P16415	610 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	PI3	P19957	117 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	HTR2C	P28335	458 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SPOCK1	Q08629	439 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CDK5R1	Q15078	307 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	LIPN	Q5VXI9	398 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CPXM2	Q8N436	756 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	PHYHIP	Q92561	330 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MALSU1	Q96EH3	234 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MC3R	P41968	323 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	HTRA3	P83110	453 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ELOC	Q15369	112 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	TEX30	Q5JUR7	227 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	LTBP1	Q14766	1721 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	C20orf202	A1L168	122 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	HEXA	P06865	529 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CST2	P09228	141 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	FUT1	P19526	365 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	OMG	P23515	440 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	GDI1	P31150	447 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	NPY4R	P50391	375 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	RNLS	Q5VYX0	342 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	COMMD1	Q8N668	190 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ASB13	Q8WXK3	278 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC39A7	Q92504	469 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	NXPE3	Q969Y0	559 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MSRA	Q9UJ68	235 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	NDUFB2	O95178	105 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ACTL6A	O96019	429 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CALCB	P10092	127 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	HOXC13	P31276	330 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	PFN3	P60673	137 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MDGA2	Q7Z553	956 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895		V9GYS6	101 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF724	A8MTY0	619 aa		10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	AGR2	O95994	175 aa		10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	SELL	P14151	372 aa		10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	GAL	P22466	123 aa		10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	BTC	P35070	178 aa		10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	CLDN2	P57739	230 aa		10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM18	Q96B42	140 aa		10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	ARSG	Q96EG1	525 aa		10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		10.4	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A0U1RQK1	487 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	C1orf226	A1L170	272 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	HMGN4	O00479	90 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	CTNS	O60931	367 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	JTB	O76095	146 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	FCGR2C	P31995	323 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	PGF	P49763	221 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	H3F3A	P84243	136 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC10A1	Q14973	349 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	GXYLT1	Q4G148	440 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF511	Q8NB15	262 aa		10.39	□□□□□ -0.75

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