RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 FNDC8Q8TC99 324 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 TSPAN32Q96QS1 320 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 FBXL3Q9UKT7 428 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 TLN2Q9Y4G6 2542 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 ZFHX3Q15911 3703 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 SH3PXD2BA1X283 911 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 MGRN1O60291 552 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 PTP4A3O75365 173 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 GADD45GO95257 159 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 FARS2O95363 451 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 RAB1AP62820 205 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 LCN8Q6JVE9 175 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 CYP2R1Q6VVX0 501 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 NUP37Q8NFH4 326 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 OR52J3Q8NH60 311 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 Q96MF0 132 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 CA10Q9NS85 328 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 A6NIZ1 184 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 ATP5HO75947 161 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 CD14P08571 375 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 ACVR1BP36896 505 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 GIPRP48546 466 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 RAP1BP61224 184 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 RAP1AP62834 184 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 SPIBQ01892 262 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 PIGFQ07326 219 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 DPPA2Q7Z7J5 298 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 NDEL1Q9GZM8 345 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 SIGLEC7Q9Y286 467 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-220ENST00000618056 C2CD3Q4AC94 2353 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 PDE5AO76074 875 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 RAB36O95755 333 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 HGFACQ04756 655 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 CD47Q08722 323 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 THEM4Q5T1C6 240 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 DHFR2Q86XF0 187 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 FGFBP3Q8TAT2 258 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 CACNG6Q9BXT2 260 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 CSPG4Q6UVK1 2322 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 TCRBV5S2A0A599 114 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 H0YHG0 523 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 SLC2A10O95528 541 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 RPL4P36578 427 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 MAGEA2P43356 314 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 MS4A2Q01362 244 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 MS4A3Q96HJ5 214 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 RBP7Q96R05 134 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 SH3GL3Q99963 347 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 AURKCQ9UQB9 309 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 H7C417 338 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 NDUFB2O95178 105 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 IGHV4-39P01824 125 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 BMP4P12644 408 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 RRM2P31350 389 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 ERVK-25P63136 954 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 CHRNB3Q05901 458 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 FMODQ06828 376 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 SWI5Q1ZZU3 235 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 FAM122BQ7Z309 247 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 ASB9Q96DX5 294 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 C18orf12Q96KH6 178 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 BDH2Q9BUT1 245 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 MAGIXQ9H6Y5 334 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 ZNF442Q9H7R0 627 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 SIAEQ9HAT2 523 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 PATE4P0C8F1 98 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 ZNF35P13682 527 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 NPR2P20594 1047 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 SERPINF1P36955 418 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 MST1LQ2TV78 715 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 SLC36A2Q495M3 483 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 SLC16A14Q7RTX9 510 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 ZER1Q7Z7L7 766 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 HTRA1Q92743 480 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 NRIP3Q9NQ35 241 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 GRHPRQ9UBQ7 328 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP21.55■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 UNC119BA6NIH7 251 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 AHCYL1O43865 530 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 KRT36O76013 467 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 SERPINA5P05154 406 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 HMGA2P52926 109 aa21.54■■□□□ 1.04
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