RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 KLHL17Q6TDP4 642 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 Q6ZT83 130 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 COMTD1Q86VU5 262 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC43A2Q8N370 569 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM81AQ8TBF8 368 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF524Q96C55 264 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PIMREGQ9BSJ6 248 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 MED17Q9NVC6 651 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 NDUFS8O00217 210 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 CLIC3O95833 236 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 IDH2P48735 452 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 HOXC5Q00444 222 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 FOXF1Q12946 379 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 CBFBQ13951 182 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SEC23BQ15437 767 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 TIMM23BQ5SRD1 257 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 C6orf141Q5SZD1 244 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR52L1Q8NGH7 329 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 POC1BQ8TC44 478 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZFAND2BQ8WV99 257 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 FOXN4Q96NZ1 517 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC38A2Q96QD8 506 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SRXN1Q9BYN0 137 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC19A3Q9BZV2 496 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 OCEL1Q9H607 264 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 C12orf10Q9HB07 376 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 CLN6Q9NWW5 311 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRSS50Q9UI38 385 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 A0A087WZY1 265 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 A0A0B4J2E0 115 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 A0A1B0GWA3 101 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 A0A1B0GX12 115 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 NUDT14O95848 222 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 YES1P07947 543 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SHC1P29353 583 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 RPL5P46777 297 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM108Q6UXF1 575 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 CLDN22Q8N7P3 220 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM234Q8WY98 164 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 KLHL15Q96M94 604 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 WFDC6Q9BQY6 131 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZAR1LA6NP61 321 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 BMP4P12644 408 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 IFI30P13284 250 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRG2P13727 222 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SFTPDP35247 375 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 HTR3AP46098 478 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 GSSP48637 474 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF83P51522 516 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 P2RX1P51575 399 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ISL1P61371 349 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 DEFA6Q01524 100 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRKCDQ05655 676 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 CD47Q08722 323 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 CDK5R2Q13319 367 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 CARTPTQ16568 116 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF544Q6NX49 715 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC27A4Q6P1M0 643 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTCHD4Q6ZW05 846 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZER1Q7Z7L7 766 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 NKAIN4Q8IVV8 208 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 NRMQ8IXM6 262 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM71CQ8NEG0 241 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF566Q969W8 418 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZBTB8AQ96BR9 441 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLEKHA8Q96JA3 519 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM192AQ9GZU8 254 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 GP6Q9HCN6 339 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ICAM5Q9UMF0 924 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 UNC119BA6NIH7 251 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR5H1A6NKK0 313 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 HMGN1P05114 100 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 IGHV1-2P23083 117 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 EDNRAP25101 427 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTAFRP25105 342 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 CD40P25942 277 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 HTR2AP28223 471 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR3A2P47893 321 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLAURQ03405 335 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SKP2Q13309 424 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 C5orf46Q6UWT4 87 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SSX8Q7RTT4 187 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms