RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606352.1

RNU6-90P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 90, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-90P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-90P-201ENST00000606352 SH3GL3Q99963 347 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 FTHL17Q9BXU8 183 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 CXCL16Q9H2A7 254 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 HOXC10Q9NYD6 342 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 DNAJB9Q9UBS3 223 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 FETUBQ9UGM5 382 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 TBK1Q9UHD2 729 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 ATG2BQ96BY7 2078 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM47DPA6NHR8 397 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 TRDCB7Z8K6 153 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 F5H6K3 240 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 H0Y626 953 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 REM1O75628 298 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 CA1P00915 261 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 CT62P0C5K7 136 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 GZMAP12544 262 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 HLA-DMAP28067 261 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 CASP14P31944 242 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 SSTR5P35346 364 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 ADRA1AP35348 466 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 RAD52P43351 418 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF138P52744 262 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 KLRC3Q07444 240 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRPSAP1Q14558 356 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 CHRNA6Q15825 494 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 ORMDL2Q53FV1 153 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 IFI44LQ53G44 452 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 MPV17L2Q567V2 206 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 CNIH2Q6PI25 160 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 PET117Q6UWS5 81 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 FBXW12Q6X9E4 464 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 KCTD9Q7L273 389 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 SERPINA12Q8IW75 414 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRSS58Q8IYP2 241 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 NANPQ8TBE9 248 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF606Q8WXB4 792 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 PTX4Q96A99 478 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 SGK3Q96BR1 496 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 TIMM17AQ99595 171 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 OSBPL10Q9BXB5 764 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 SIRPDQ9H106 197 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 VPS37BQ9H9H4 285 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 POPDC2Q9HBU9 364 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 KIAA1257Q9ULG3 409 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 LIPT1Q9Y234 373 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 HYOU1Q9Y4L1 999 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 MSH6P52701 1360 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 LAMA4Q16363 1823 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 TNCP24821 2201 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A1B0GUH1 482 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 CHST10O43529 356 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 SH3BP5O60239 455 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 UPK3AO75631 287 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 RAB3DO95716 219 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHG2P01859 326 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHG4P01861 327 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 OPN1MWP04001 364 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 OPN1MW2P0DN77 364 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 OPN1MW3P0DN78 364 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 TPSB2P20231 275 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 MSR1P21757 451 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 CD1CP29017 333 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRDX2P32119 198 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 LGALS7P47929 136 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 NPBWR2P48146 333 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 FOXA1P55317 472 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 TPSAB1Q15661 275 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 CARTPTQ16568 116 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 DEFB115Q30KQ5 88 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 KCTD16Q68DU8 428 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 TEX43Q6ZNM6 134 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 PCGF5Q86SE9 256 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 PIANPQ8IYJ0 282 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR5T1Q8NG75 326 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 TESK2Q96S53 571 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 RBBP8Q99708 897 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 RSG1Q9BU20 258 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 CHCHD7Q9BUK0 85 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 GBA3Q9H227 469 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 TUBA4BQ9H853 241 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 STX8Q9UNK0 236 aa-0.64□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms