RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 DACH2Q96NX9 599 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 TSPAN32Q96QS1 320 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 GRIP2Q9C0E4 1043 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 IL20RAQ9UHF4 553 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 KLHL21Q9UJP4 597 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 CLEC4AQ9UMR7 237 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 DOCK7Q96N67 2140 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 CUBNO60494 3623 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 XKRYO14609 159 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC43A1O75387 559 aa20.8■□□□□ 0.92
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CAPNS1-214ENST00000592483 IFNGP01579 166 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 IGHG1P01857 330 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 HSPA13P48723 471 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 BIDP55957 195 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
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CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF555Q8NEP9 628 aa20.8■□□□□ 0.92
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CAPNS1-214ENST00000592483 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 LRR1Q96L50 414 aa20.8■□□□□ 0.92
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CAPNS1-214ENST00000592483 MBOAT4Q96T53 435 aa20.8■□□□□ 0.92
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CAPNS1-214ENST00000592483 PIGMQ9H3S5 423 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 MED29Q9NX70 200 aa20.8■□□□□ 0.92
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CAPNS1-214ENST00000592483 SLC35F4A4IF30 521 aa20.79■□□□□ 0.92
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CAPNS1-214ENST00000592483 SLC16A6O15403 523 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF432O94892 652 aa20.79■□□□□ 0.92
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CAPNS1-214ENST00000592483 ACVR1BP36896 505 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 OR3A2P47893 321 aa20.79■□□□□ 0.92
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CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF566Q969W8 418 aa20.79■□□□□ 0.92
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CAPNS1-214ENST00000592483 H0YAE9 185 aa20.77■□□□□ 0.92
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CAPNS1-214ENST00000592483 KCNK17Q96T54 332 aa20.77■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
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CAPNS1-214ENST00000592483 PGA3P0DJD8 388 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-214ENST00000592483 GGT2P36268 569 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-214ENST00000592483 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-214ENST00000592483 CSNK1A1P48729 337 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-214ENST00000592483 SELENOPP49908 381 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-214ENST00000592483 CLRN1P58418 232 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXF2Q12947 444 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-214ENST00000592483 STK11Q15831 433 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-214ENST00000592483 MESTQ5EB52 335 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-214ENST00000592483 ACSM5Q6NUN0 579 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-214ENST00000592483 C20orf196Q8IYI0 205 aa20.76■□□□□ 0.91
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