RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 TP53I3Q53FA7 332 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM109AQ8N4B1 249 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SYT14Q8NB59 555 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 OR9K2Q8NGE7 335 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SNX33Q8WV41 574 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 UCN2Q96RP3 112 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 EMC6Q9BV81 110 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TIGARQ9NQ88 270 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF726A6NNF4 738 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 HSPB2A8KAH6 182 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 E9PI62 339 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 H0YC42 278 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 KLK10O43240 276 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SULT1C4O75897 302 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CELP19835 753 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TGFBR1P36897 503 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 RFC3P40938 356 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 EGR3Q06889 387 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAM1Q15629 374 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 HSPB2Q16082 182 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 DGUOKQ16854 277 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC58Q4VC31 144 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00299Q6ZSB3 139 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ZFP41Q8N8Y5 198 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF454Q8N9F8 522 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC26A10Q8NG04 563 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 OR6N2Q8NGY6 317 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10D3Q8NH80 312 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 OTOSQ8NHW6 89 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 RPS4Y2Q8TD47 263 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 PELI1Q96FA3 418 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SCNM1Q9BWG6 230 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 RERGLQ9H628 205 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ALPK2Q86TB3 2170 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 MED12Q93074 2177 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 PRR32B1ATL7 298 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CXCL13O43927 109 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 GPANK1O95872 356 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ACTL6AO96019 429 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 HLA-DPB1P04440 258 aa20.27■□□□□ 0.84
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CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF708P17019 499 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TGM4P49221 684 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ENTPD1P49961 510 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CLDN18P56856 261 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CLRN1P58418 232 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 FMODQ06828 376 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC10A1Q14973 349 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TRILQ7L0X0 811 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ZIC4Q8N9L1 334 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ZFAND2BQ8WV99 257 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ASB17Q8WXJ9 295 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM54Q969K7 222 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF167Q9H6Y7 350 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 LAMP5Q9UJQ1 280 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 MSRB2Q9Y3D2 182 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV17A0A0B4J275 112 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 METTL15A6NJ78 407 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 NPIPA2E9PIF3 369 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 NPIPA3F8WFD2 350 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 ACOT7O00154 380 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 CLPXO76031 633 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 ABHD16AO95870 558 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TACSTD2P09758 323 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 PSKH1P11801 424 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 CLDN17P56750 224 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 SIRPAP78324 504 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 FABP5Q01469 135 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 CAMK2DQ13557 499 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 DPY19L4Q7Z388 723 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 GLB1L2Q8IW92 636 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC6A15Q9H2J7 730 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF716A6NP11 495 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 CYTIPO60759 359 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 AQP8O94778 261 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF432O94892 652 aa20.25■□□□□ 0.83
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