RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 RAB1AP62820 205 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PPP2R2BQ00005 443 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 MYBPC1Q00872 1141 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 TRAM2Q15035 370 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 GLYATQ6IB77 296 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 UGT2A3Q6UWM9 527 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF730Q6ZMV8 503 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CYP4Z1Q86W10 505 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SYT14Q8NB59 555 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM54Q969K7 222 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 BPIFA2Q96DR5 249 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 POM121Q96HA1 1249 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 REG4Q9BYZ8 158 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SPAG4Q9NPE6 437 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 RPS6KA6Q9UK32 745 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 A4GNTQ9UNA3 340 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SH3PXD2BA1X283 911 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 B9A039 149 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PIP5K1CO60331 668 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 UBL3O95164 117 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV1-44P01699 117 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PATE4P0C8F1 98 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PGA4P0DJD7 388 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PGA3P0DJD8 388 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 NPR2P20594 1047 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PCSK6P29122 969 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 RANBP1P43487 201 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 GIPRP48546 466 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 DSCR9P59020 149 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 GALK2Q01415 458 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 DAG1Q14118 895 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CARTPTQ16568 116 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ALG10Q5BKT4 473 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 KRT80Q6KB66 452 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CBLL1Q75N03 491 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SPATA24Q86W54 205 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 WDFY1Q8IWB7 410 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SKA3Q8IX90 412 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 RNF148Q8N7C7 305 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 OR4K5Q8NGD3 323 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 OR51A7Q8NH64 312 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 MOSPD2Q8NHP6 518 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF347Q96SE7 839 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 THTPAQ9BU02 230 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PLK3Q9H4B4 646 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 RAB26Q9ULW5 256 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 FKBP7Q9Y680 259 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 HTR3EA5X5Y0 456 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 EFCAB9A8MZ26 197 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 H0YJX3 145 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 H7C417 338 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 hCG_2039718K7EN88 272 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 LY6HO94772 140 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 BAG2O95816 211 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 IGF2P01344 180 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 MAKP20794 623 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 THBS4P35443 961 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 EFNA4P52798 201 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CTXN1P60606 82 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 HGFACQ04756 655 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 PLP2Q04941 152 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 RUNX1T1Q06455 604 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CD47Q08722 323 aa7.21□□□□□ -1.26
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