RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580828.1

SNHG25-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 25, humanhuman

TSL 2

Gene SNHG25, Length 106 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG25-201ENST00000580828 C1orf198Q9H425 327 aa10.5□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 SIAEQ9HAT2 523 aa10.5□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 RHCGQ9UBD6 479 aa10.5□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 ENPP4Q9Y6X5 453 aa10.5□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 A0A087WUU8 490 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 SLC22A23A1A5C7 686 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 EFCAB9A8MZ26 197 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 J3KTA2 159 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 CD5LO43866 347 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 PIP5K1CO60331 668 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 PRSS23O95084 383 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 IGHMP01871 453 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 PATE4P0C8F1 98 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 NCK1P16333 377 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 MAKP20794 623 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 CTXN1P60606 82 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 RPL27P61353 136 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP10.49□□□□□ -0.736e-13■■□□□ 13.3
SNHG25-201ENST00000580828 PLP2Q04941 152 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 THEM4Q5T1C6 240 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 GLYATQ6IB77 296 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 ZNF730Q6ZMV8 503 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 SLC16A14Q7RTX9 510 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 SVOPLQ8N434 492 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 FAM156AQ8NDB6 213 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 ZNF540Q8NDQ6 660 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 OR1J2Q8NGS2 313 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 FGFBP3Q8TAT2 258 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 RBP7Q96R05 134 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 KCNK17Q96T54 332 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 KCNN2Q9H2S1 579 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 GORASP2Q9H8Y8 452 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 RNF121Q9H920 327 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 ADA2Q9NZK5 511 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 SLC7A8Q9UHI5 535 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 TMEM5Q9Y2B1 443 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 RTTNQ86VV8 2226 aa10.49□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 A0A1W2PRQ8 180 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 A6NIZ1 184 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 SYNGR3O43761 229 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 LY6HO94772 140 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 H1F0P07305 194 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 RHCEP18577 417 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 FUT4P22083 530 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 USF1P22415 310 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 RAP1BP61224 184 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 RAP1AP62834 184 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 GNGT1P63211 74 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 VLDLRP98155 873 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 MYBPC1Q00872 1141 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 CD47Q08722 323 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 DGCR6Q14129 220 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 FXNQ16595 210 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 TMEM249Q2WGJ8 235 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 PIGWQ7Z7B1 504 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 ZNF584Q8IVC4 421 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 ANKS4BQ8N8V4 417 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 LRRC75AQ8NAA5 344 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 SLC30A7Q8NEW0 376 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 OR51A7Q8NH64 312 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 LRRC37BQ96QE4 947 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 PIMREGQ9BSJ6 248 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 NDEL1Q9GZM8 345 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 LRMDAQ9H2I8 198 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 MS4A5Q9H3V2 200 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 DYNLRB1Q9NP97 96 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 EGFL7Q9UHF1 273 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 CR1P17927 2039 aa10.48□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 TRAV27A0A087WT01 109 aa10.47□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa10.47□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 VWC2LB2RUY7 222 aa10.47□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 AHCYL1O43865 530 aa10.47□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 GPRIN2O60269 458 aa10.47□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 CRLF1O75462 422 aa10.47□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 DCTN3O75935 186 aa10.47□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 SNAP29O95721 258 aa10.47□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 ADRA2AP08913 450 aa10.47□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 HSD17B1P14061 328 aa10.47□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 ITGA2P17301 1181 aa10.47□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 NR4A2P43354 598 aa10.47□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 SELENOVP59797 346 aa10.47□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 FHL1Q13642 323 aa10.47□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 SPATS1Q496A3 300 aa10.47□□□□□ -0.73
SNHG25-201ENST00000580828 ZBED5Q49AG3 693 aa10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms