RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 CYSLTR2Q9NS75 346 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MOKQ9UQ07 419 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 LOC400499M0QZD8 3231 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAMP1O60894 148 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ITGA10O75578 1167 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PNPP00491 289 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MT-ATP6P00846 226 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPARCP09486 303 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SRMP19623 302 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MAP2K3P46734 347 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAM1Q15629 374 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 BCL2A1Q16548 175 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 GPR139Q6DWJ6 353 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 WDSUB1Q8N9V3 476 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPS4Y2Q8TD47 263 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ELP5Q8TE02 316 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 RNF138Q8WVD3 245 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 BRD7Q9NPI1 651 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC22A13Q9Y226 551 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ALG5Q9Y673 324 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF879B4DU55 563 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 H0YC42 278 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 LYRM1O43325 122 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ADRA2CP18825 462 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCKBRP32239 447 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIR3DL2P43630 455 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PLA2G7Q13093 441 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 IL11RAQ14626 422 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PLPPR5Q32ZL2 321 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 HSD17B12Q53GQ0 312 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRSS45Q7RTY3 260 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 NUP54Q7Z3B4 507 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 LURAP1LQ8IV03 231 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 NXPE2Q96DL1 559 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 C5orf34Q96MH7 638 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 HDHD2Q9H0R4 259 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF281Q9Y2X9 895 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 WIF1Q9Y5W5 379 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PCSK5Q92824 1860 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 FLRT2O43155 660 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SEC14L5O43304 696 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 FZD7O75084 574 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 FBXO45P0C2W1 286 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 COX6A1P12074 109 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRKACBP22694 351 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 S100A1P23297 94 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PUDPQ08623 228 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCDC58Q4VC31 144 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PLET1Q6UQ28 207 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TPRA1Q86W33 373 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00346Q8IVM7 164 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SERPINA12Q8IW75 414 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TEX19Q8NA77 164 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR5L2Q8NGL0 311 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR2G2Q8NGZ5 317 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 OTOSQ8NHW6 89 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 STK35Q8TDR2 534 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM234Q8WY98 164 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 KLHL15Q96M94 604 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ELOVL3Q9HB03 270 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC39A1Q9NY26 324 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRABD2BA6NFA1 517 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 HMX3A6NHT5 357 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR4C45A6NMZ5 311 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 CENPXA8MT69 81 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 NOTOA8MTQ0 251 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PTHLHP12272 177 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SFTPDP35247 375 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 DDOSTP39656 456 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPS15P62841 145 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MC2RQ01718 297 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MYBPHQ13203 477 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 CORO6Q6QEF8 472 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR5AK2Q8NH90 309 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ST8SIA1Q92185 356 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 NSMAFQ92636 917 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms