RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222		U3KQV3	271 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	GNGT2	O14610	69 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	OR10H3	O60404	316 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	CCNB2	O95067	398 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	OR6A2	O95222	327 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	HLA-DOB	P13765	273 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ZNF43	P17038	809 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	IFNGR2	P38484	337 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	OR3A2	P47893	321 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	FABP6	P51161	128 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ZNF83	P51522	516 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	LAPTM4A	Q15012	233 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	PPA1	Q15181	289 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ATP6AP1	Q15904	470 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	MICA	Q29983	383 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	PXK	Q7Z7A4	578 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	UEVLD	Q8IX04	471 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	TMEM45B	Q96B21	275 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	NTN4	Q9HB63	628 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	C11orf98	E9PRG8	122 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222		H3BNX3	289 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	RNF13	O43567	381 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ENTPD5	O75356	428 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	PTP4A3	O75365	173 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	FCGR1A	P12314	374 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	AHCY	P23526	432 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	FPR3	P25089	353 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	FAS	P25445	335 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	AQP2	P41181	271 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	GSS	P48637	474 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	EFNA4	P52798	201 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	IL1RL1	Q01638	556 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	MIDN	Q504T8	468 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	SLC22A25	Q6T423	547 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	OR51A7	Q8NH64	312 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	NGB	Q9NPG2	151 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		12	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	UNC119B	A6NIH7	251 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	GAST	P01350	101 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	CLDN17	P56750	224 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	TSPAN31	Q12999	210 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ITGAD	Q13349	1161 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ZBED5	Q49AG3	693 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	CASP12	Q6UXS9	341 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	AAED1	Q7RTV5	226 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	OR52N5	Q8NH56	324 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	GIPC3	Q8TF64	312 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	APH1A	Q96BI3	265 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	RCE1	Q9Y256	329 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222		A0A0G2JK05	382 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	TMEM89	A2RUT3	159 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222		H7C417	338 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	TMPRSS2	O15393	492 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	E2F6	O75461	281 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ZNF432	O94892	652 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	IGHV3-9	P01782	118 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	F13B	P05160	661 aa		11.98	□□□□□ -0.49

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