RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	CDA	P32320	146 aa		18.05	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	LIMS1	P48059	325 aa		18.05	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	CTXN1	P60606	82 aa		18.05	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	18.05	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	RAB39A	Q14964	217 aa		18.05	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	FGD3	Q5JSP0	725 aa		18.05	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	C16orf89	Q6UX73	402 aa		18.05	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		18.05	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		18.05	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	18.05	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	18.05	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	18.05	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	RTTN	Q86VV8	2226 aa		18.04	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	HIVEP2	P31629	2446 aa		18.04	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	RNF223	E7ERA6	249 aa		18.04	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	GMNN	O75496	209 aa		18.04	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	UBL3	O95164	117 aa		18.04	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	T-ENOL	P0DO92	83 aa		18.04	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	OMP	P47874	163 aa		18.04	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	SLC9A3	P48764	834 aa		18.04	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	18.04	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	KRT80	Q6KB66	452 aa		18.04	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		18.04	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		18.04	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	NABP1	Q96AH0	204 aa		18.04	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		18.04	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	GPA33	Q99795	319 aa		18.04	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		18.04	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		18.04	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	TMEM129	A0AVI4	362 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996		B2RBV5	119 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	GPRIN2	O60269	458 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	PDE5A	O76074	875 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	RAB36	O95755	333 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ATP6V1B2	P21281	511 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	NR4A1	P22736	598 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	NUDT6	P53370	316 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ERVK-25	P63136	954 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	MXRA7	P84157	204 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	CHRNB3	Q05901	458 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	CD47	Q08722	323 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	RAB35	Q15286	201 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	TAF11	Q15544	211 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	EFNB3	Q15768	340 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ZNF525	Q8N782	197 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	OR52J3	Q8NH60	311 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	NSMAF	Q92636	917 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	NSL1	Q96IY1	281 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ALG12	Q9BV10	488 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	PLK3	Q9H4B4	646 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	NDE1	Q9NXR1	346 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	JMJD1C	Q15652	2540 aa		18.03	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996		A0A096LNT2	108 aa		18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	PTP4A3	O75365	173 aa		18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	SERPINA5	P05154	406 aa		18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	HEXA	P06865	529 aa		18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ZNF84	P51523	738 aa		18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	FXYD6P3	P58550	94 aa		18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	DAG1	Q14118	895 aa		18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	SPATS1	Q496A3	300 aa		18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	NRN1L	Q496H8	165 aa		18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ZBED5	Q49AG3	693 aa		18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	RINL	Q6ZS11	566 aa		18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	REG4	Q9BYZ8	158 aa		18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		18.02	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ABCA1	O95477	2261 aa		18.01	■□□□□ 0.47
CS-222	ENST00000550996		B9A039	149 aa		18.01	■□□□□ 0.47
CS-222	ENST00000550996		H7C1C5	153 aa		18.01	■□□□□ 0.47
CS-222	ENST00000550996	EFNA4	P52798	201 aa		18.01	■□□□□ 0.47
CS-222	ENST00000550996	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
CS-222	ENST00000550996	LCN6	P62502	163 aa		18.01	■□□□□ 0.47
CS-222	ENST00000550996	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
CS-222	ENST00000550996	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		18.01	■□□□□ 0.47
CS-222	ENST00000550996	FAM122B	Q7Z309	247 aa		18.01	■□□□□ 0.47
CS-222	ENST00000550996	CDK20	Q8IZL9	346 aa		18.01	■□□□□ 0.47
CS-222	ENST00000550996	SVOPL	Q8N434	492 aa		18.01	■□□□□ 0.47
CS-222	ENST00000550996	LRRC18	Q8N456	261 aa		18.01	■□□□□ 0.47
CS-222	ENST00000550996	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		18.01	■□□□□ 0.47
CS-222	ENST00000550996		Q96M85	177 aa		18.01	■□□□□ 0.47
CS-222	ENST00000550996	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		18.01	■□□□□ 0.47
CS-222	ENST00000550996	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		18	■□□□□ 0.47
CS-222	ENST00000550996	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	18	■□□□□ 0.47
CS-222	ENST00000550996	CD14	P08571	375 aa		18	■□□□□ 0.47

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