RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549194.1

GNPTAB-204, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-204ENST00000549194 TSPAN4O14817 238 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 XRCC3O43542 346 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 DNAJB6O75190 326 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 RBBP9O75884 186 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 GLCEO94923 617 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 IGF2P01344 180 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 HRGP04196 525 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 GYPBP06028 91 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 UBBP0CG47 229 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 RPA2P15927 270 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 SPI1P17947 270 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 NAT1P18440 290 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 CDK2P24941 298 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 CFPP27918 469 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 GABRA3P34903 492 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 DRD3P35462 400 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 PRPS1P60891 318 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 RPS21P63220 83 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 CBFBQ13951 182 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 ZNF273Q14593 569 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 CST6Q15828 149 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 ZNF528Q3MIS6 628 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 ALG10BQ5I7T1 473 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 TMEM255AQ5JRV8 349 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 MANEAQ5SRI9 462 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 ZNF684Q5T5D7 378 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 GSG1LQ6UXU4 331 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 CDH26Q8IXH8 852 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 ZNF440Q8IYI8 595 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 ARL14Q8N4G2 192 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 ZBTB44Q8NCP5 570 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 BVESQ8NE79 360 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 SDR9C7Q8NEX9 313 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 OR6N1Q8NGY5 312 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 OR4K13Q8NH42 304 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 CCDC107Q8WV48 283 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 HMGB4Q8WW32 186 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 FAM168AQ92567 244 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 PIGKQ92643 395 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 LINC00052Q96N35 136 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 OR2M4Q96R27 311 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 SLC25A18Q9H1K4 315 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 SLC17A5Q9NRA2 495 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 CA10Q9NS85 328 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 MTFP1Q9UDX5 166 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 OPN4Q9UHM6 478 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 FBXL4Q9UKA2 621 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 OR52A4PA6NMU1 304 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 ANXA2P2A6NMY6 339 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 PHYHO14832 338 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 MELTFP08582 738 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 ADRB1P08588 477 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 NPIPA8P0DM63 369 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 AK4P27144 223 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 AGTR1P30556 359 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 HOXA6P31267 233 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 PSMB10P40306 273 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 TPMTP51580 245 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 HCCSP53701 268 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 KIAA1024LP59773 190 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 MGAT2Q10469 447 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 ENPP2Q13822 863 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 ZNF141Q15928 474 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 DEFB134Q4QY38 66 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 OR5M10Q6IEU7 315 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 FBXO42Q6P3S6 717 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 MTFR2Q6P444 385 aa7.49□□□□□ -1.21
GNPTAB-204ENST00000549194 FIGLAQ6QHK4 219 aa7.49□□□□□ -1.21
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