RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	TSPAN31	Q12999	210 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	HIST3H3	Q16695	136 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	C10orf128	Q5T292	105 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	AGAP6	Q5VW22	663 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	VHLL	Q6RSH7	139 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF627	Q7L945	461 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	LRRC18	Q8N456	261 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF519	Q8TB69	540 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	RASD2	Q96D21	266 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059		Q96M85	177 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	SH3GL3	Q99963	347 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	IFT27	Q9BW83	186 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	OR52D1	Q9H346	318 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	RERGL	Q9H628	205 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	PDZD2	O15018	2839 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	TMCC2	O75069	709 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	PPP1R3D	O95685	299 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	CELA3B	P08861	270 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	GIPR	P48546	466 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	GALK2	Q01415	458 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	PLP2	Q04941	152 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	FHL1	Q13642	323 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	SGCA	Q16586	387 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	NRN1L	Q496H8	165 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	MEST	Q5EB52	335 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF544	Q6NX49	715 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	ADCK1	Q86TW2	530 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	SKA3	Q8IX90	412 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	MUC15	Q8N387	334 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	HTRA1	Q92743	480 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	GPA33	Q99795	319 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	LRBA	P50851	2863 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	VSTM5	A8MXK1	200 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059		E7EQL1	145 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	MGRN1	O60291	552 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	PTP4A3	O75365	173 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	REN	P00797	406 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	PTH	P01270	115 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	IGLV1-44	P01699	117 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	SOD3	P08294	240 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	PATE4	P0C8F1	98 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	BMP4	P12644	408 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	CDA	P32320	146 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	GSS	P48637	474 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	CENPA	P49450	140 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	ARHGDIA	P52565	204 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	HMGA2	P52926	109 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	CBX1	P83916	185 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	HSF2	Q03933	536 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	GK3P	Q14409	553 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	RAB39A	Q14964	217 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	MICA	Q29983	383 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	RFX4	Q33E94	735 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	FAM122B	Q7Z309	247 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	SAMD8	Q96LT4	415 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	SIAE	Q9HAT2	523 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	POLQ	O75417	2590 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CHID1-222	ENST00000533059	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		12.02	□□□□□ -0.49

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