RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531867.1

PUM1-222, Transcript of pumilio RNA binding family member 1, human

TSL 4

Gene PUM1, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM1-222	ENST00000531867	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	PLCE1	Q9P212	2302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	RYR3	Q15413	4870 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867		A0A087X0K7	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867		B4DXG7	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	NDUFS8	O00217	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CLOCK	O15516	846 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	XRCC3	O43542	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	NDUFB4	O95168	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	STAMBP	O95630	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	SERPINA3	P01011	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CSN3	P07498	182 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	EFNA4	P52798	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	PLA2G16	P53816	162 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	HERVK_113	P63132	956 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ERVK-8	P63133	956 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ACTG1	P63261	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CRADD	P78560	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	DOC2A	Q14183	400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	TAB1	Q15750	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	STK11	Q15831	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	AGAP6	Q5VW22	663 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	NEPRO	Q6NW34	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	KLC3	Q6P597	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	RNF138	Q8WVD3	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	HSD17B8	Q92506	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	NODAL	Q96S42	347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ALG12	Q9BV10	488 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	WDR76	Q9H967	626 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	LGALS8	O00214	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	RAMP1	O60894	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	AQP8	O94778	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	APRT	P07741	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF23	P17027	643 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	HTR2A	P28223	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	PRDX6	P30041	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	MAPK12	P53778	367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	RWDD2B	P57060	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	HILS1	P60008	231 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	RAB35	Q15286	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	SPERT	Q8NA61	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TANK	Q92844	425 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	S100PBP	Q96BU1	408 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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