RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511669.1

CXCL3-204, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL3, Length 1,641 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-204ENST00000511669 PSMD7P51665 324 aa14.77□□□□□ -0.04
CXCL3-204ENST00000511669 CCR9P51686 369 aa14.77□□□□□ -0.04
CXCL3-204ENST00000511669 BIDP55957 195 aa14.77□□□□□ -0.04
CXCL3-204ENST00000511669 GPR85P60893 370 aa14.77□□□□□ -0.04
CXCL3-204ENST00000511669 ROM1Q03395 351 aa14.77□□□□□ -0.04
CXCL3-204ENST00000511669 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
CXCL3-204ENST00000511669 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
CXCL3-204ENST00000511669 Q499Y3 187 aa14.77□□□□□ -0.04
CXCL3-204ENST00000511669 TEX30Q5JUR7 227 aa14.77□□□□□ -0.04
CXCL3-204ENST00000511669 ACER2Q5QJU3 275 aa14.77□□□□□ -0.04
CXCL3-204ENST00000511669 FDX2Q6P4F2 183 aa14.77□□□□□ -0.04
CXCL3-204ENST00000511669 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.77□□□□□ -0.04
CXCL3-204ENST00000511669 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.77□□□□□ -0.04
CXCL3-204ENST00000511669 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.77□□□□□ -0.04
CXCL3-204ENST00000511669 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa14.77□□□□□ -0.04
CXCL3-204ENST00000511669 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
CXCL3-204ENST00000511669 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
CXCL3-204ENST00000511669 SHISA3A0PJX4 238 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 AQP7P3A6NL99 342 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 ZNF726A6NNF4 738 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 STMND1H3BQB6 276 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 MAGEB3O15480 346 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 DNPH1O43598 174 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 EFNA2O43921 213 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 RAD1O60671 282 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 HPGDSO60760 199 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 ABHD16AO95870 558 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 HLA-DOBP13765 273 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 SRD5A2P31213 254 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 SFTPDP35247 375 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 INPP1P49441 399 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 IL18Q14116 193 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 SLC17A1Q14916 467 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 TRIQKQ629K1 86 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 CNIH2Q6PI25 160 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 DHRS13Q6UX07 377 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 GLRX5Q86SX6 157 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 KDM8Q8N371 416 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 GPR148Q8TDV2 347 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 KCNE4Q8WWG9 221 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 NTNG2Q96CW9 530 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 CMTM3Q96MX0 182 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 OR14A2Q96R54 314 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 TCF7L1Q9HCS4 588 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 KCNG2Q9UJ96 466 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa14.77□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 FUOMA2VDF0 154 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 PSMD9O00233 223 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 CDK2AP1O14519 115 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 ZFPL1O95159 310 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 SRMP19623 302 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 CD82P27701 267 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 RIN1Q13671 783 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 DEGS2Q6QHC5 323 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 OR2G2Q8NGZ5 317 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 OR52N5Q8NH56 324 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 OR6X1Q8NH79 312 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 TMEM185BQ9H7F4 350 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 ELOVL3Q9HB03 270 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 ETAA1Q9NY74 926 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 FOXJ2Q9P0K8 574 aa14.76□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 A0A1W2PNR3 127 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 IL7P13232 177 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 APEX1P27695 318 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 PTGS2P35354 604 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 RAC1P63000 192 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 TOMM20Q15388 145 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 ZNF79Q15937 498 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 MEP1BQ16820 701 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 GPAT4Q86UL3 456 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 NOXO1Q8NFA2 376 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 RNF128Q8TEB7 428 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 DERL3Q96Q80 235 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 NOX4Q9NPH5 578 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 MED29Q9NX70 200 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 HRH3Q9Y5N1 445 aa14.75□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 TNFSF15O95150 251 aa14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CXCL3-204ENST00000511669 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms