RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 DGCR6Q14129 220 aa16.18■□□□□ 0.18
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SH3BP2-218ENST00000511185 C10orf128Q5T292 105 aa16.18■□□□□ 0.18
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SH3BP2-218ENST00000511185 NUP37Q8NFH4 326 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 NSMAFQ92636 917 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 NABP1Q96AH0 204 aa16.18■□□□□ 0.18
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SH3BP2-218ENST00000511185 SSX4O60224 188 aa16.17■□□□□ 0.18
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SH3BP2-218ENST00000511185 RAB1AP62820 205 aa16.17■□□□□ 0.18
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SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF35P13682 527 aa16.16■□□□□ 0.18
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SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 RASD2Q96D21 266 aa16.16■□□□□ 0.18
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SH3BP2-218ENST00000511185 SLC16A14Q7RTX9 510 aa16.15■□□□□ 0.18
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SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM5Q9Y2B1 443 aa16.15■□□□□ 0.18
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SH3BP2-218ENST00000511185 FARS2O95363 451 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 HEXAP06865 529 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
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SH3BP2-218ENST00000511185 RRM2P31350 389 aa16.14■□□□□ 0.17
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SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF570Q96NI8 536 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXN4Q96NZ1 517 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 OR51B6Q9H340 312 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 PLK3Q9H4B4 646 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SMURF2Q9HAU4 748 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A096LNT2 108 aa16.13■□□□□ 0.17
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SH3BP2-218ENST00000511185 GADD45GO95257 159 aa16.13■□□□□ 0.17
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