RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 MOGQ16653 247 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 C3P1Q6ZMU1 363 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ANGPTL4Q9BY76 406 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ENPP5Q9UJA9 477 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA1671Q9BY89 1806 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 PRSS23O95084 383 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 SCG5P05408 212 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 RAB25P57735 213 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 SLC35A2P78381 396 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF45Q02386 682 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 GALEQ14376 348 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
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PTPRD-211ENST00000486161 AWAT2Q6E213 333 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 XKRXQ6PP77 449 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 MUL1Q969V5 352 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 FAM46BQ96A09 425 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 OR51E2Q9H255 320 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 GLTPQ9NZD2 209 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 B9D1Q9UPM9 204 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 MAGEA5P43359 124 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 MAP2K3P46734 347 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ART1P52961 327 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 GHSRQ92847 366 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 TMIGD2Q96BF3 282 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 EMC7Q9NPA0 242 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF639Q9UID6 485 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 DNPH1O43598 174 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 RAD51DO75771 328 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 NFATC3Q12968 1075 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 C12orf73Q69YU5 71 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 TPRA1Q86W33 373 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ADGRG3Q86Y34 549 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 OR4D11Q8NGI4 311 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 PHYHIPQ92561 330 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 MICU1Q9BPX6 476 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 SEMA5BQ9P283 1151 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 FBXL2Q9UKC9 423 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ICAM5Q9UMF0 924 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 C9orf172C9J069 976 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 RECKO95980 971 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 EPHA2P29317 976 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ATP1B3P54709 279 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 CDK5Q00535 292 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 COX15Q7KZN9 410 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 VOPP1Q96AW1 172 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 TSSK2Q96PF2 358 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 GLRX2Q9NS18 164 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF226Q9NYT6 803 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 HSPB2A8KAH6 182 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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PTPRD-211ENST00000486161 GABRA4P48169 554 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF136P52737 540 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 EFNA3P52797 238 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 SLC25A1P53007 311 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ARPC4P59998 168 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 HSPB2Q16082 182 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 Q499Y3 187 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 SYS1Q8N2H4 156 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 NPRL2Q8WTW4 380 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 MIB2Q96AX9 1013 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 SLAMF6Q96DU3 332 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 SCGB3A2Q96PL1 93 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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PTPRD-211ENST00000486161 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 DUSP21Q9H596 190 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 OR52A1Q9UKL2 312 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 PLPP3O14495 311 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 CAPNS1P04632 268 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 CD3GP09693 182 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 PRKACBP22694 351 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 GLP1RP43220 463 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 CBX5P45973 191 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 EGR3Q06889 387 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 GPR50Q13585 617 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
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