RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479043.1

ANKRD28-210, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-210ENST00000479043 DRC3Q9H069 523 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC25A51Q9H1U9 297 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 FAM96AQ9H5X1 160 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 ASB8Q9H765 288 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 COG4Q9H9E3 785 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 CALHM2Q9HA72 323 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 NMRAL1Q9HBL8 299 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 MIEF1Q9NQG6 463 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 C1orf123Q9NWV4 160 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 MARCH5Q9NX47 278 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 OR12D3Q9UGF7 316 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 RIMS3Q9UJD0 308 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 MGAT4BQ9UQ53 548 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 SCML2Q9UQR0 700 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 POMPQ9Y244 141 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 ASB3Q9Y575 518 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 DOCK3Q8IZD9 2030 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 BRCA2P51587 3418 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 HEATR9A2RTY3 570 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 GOLGA8OA6NCC3 632 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 GOLGA8NF8WBI6 632 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 K7EPI3 171 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 M0QZ92 97 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 FXYD1O00168 92 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 DFFAO00273 331 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 CCL22O00626 93 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 CASKO14936 926 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 EFNA2O43921 213 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 FKBP6O75344 327 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 SCGB2A1O75556 95 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 B3GALNT1O75752 331 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 CIB2O75838 187 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 ZMPSTE24O75844 475 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 B3GAT3O94766 335 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 OR4F21O95013 312 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 VAPBO95292 243 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 ASGR1P07306 291 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 NEFHP12036 1026 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 SDC1P18827 310 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 ATF6P18850 670 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 PAX7P23759 505 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 CCR1P32246 355 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 ACVR1BP36896 505 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC26A3P40879 764 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 PSMD8P48556 350 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 RPL14P50914 215 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 CDKN2DP55273 166 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 LIM2P55344 173 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 C1QTNF8P60827 252 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 RPL26P61254 145 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 XIAPP98170 497 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC10A7Q0GE19 358 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 PDZK1IP1Q13113 114 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 PRPSAP1Q14558 356 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 GPNMBQ14956 572 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 TRIP10Q15642 601 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 INAQ16352 499 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 PSMD5Q16401 504 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 LINC01620Q4KN68 170 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 CYBRD1Q53TN4 286 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 SFT2D3Q587I9 215 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 PIGGQ5H8A4 983 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 SDHAF4Q5VUM1 108 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 C1orf146Q5VVC0 180 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 MFSD14CQ5VZR4 134 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 UFSP1Q6NVU6 142 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF544Q6NX49 715 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 UGT2A3Q6UWM9 527 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 MISPQ8IVT2 679 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 DEFB107AQ8IZN7 70 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 GCNT2Q8N0V5 402 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 ANKRD49Q8WVL7 239 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 PYDC1Q8WXC3 89 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 STMN2Q93045 179 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 UPRTQ96BW1 309 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 RCN3Q96D15 328 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 CMTM5Q96DZ9 223 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 RILPQ96NA2 401 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 OMDQ99983 421 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 ECSITQ9BQ95 431 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 THTPAQ9BU02 230 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD28-210ENST00000479043 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms