RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473034.5

RNF25-204, Transcript of ring finger protein 25, human

TSL 2

Gene RNF25, Length 1,807 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF25-204	ENST00000473034	MEN1	O00255	615 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	SLC17A2	O00624	439 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	GPANK1	O95872	356 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	IGHM	P01871	453 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	CXCR1	P25024	350 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	COMMD7	Q86VX2	200 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	TSLP	Q969D9	159 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	CUTC	Q9NTM9	273 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	KIF25	Q9UIL4	384 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	NUP50	Q9UKX7	468 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	THADA	Q6YHU6	1953 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	PRSS37	A4D1T9	235 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	MELTF	P08582	738 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	EFNB2	P52799	333 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	AANAT	Q16613	207 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	MEP1B	Q16820	701 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	GKN2	Q86XP6	184 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	SLC25A28	Q96A46	364 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	C8orf44	Q96CB5	159 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	MVB12A	Q96EY5	273 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	WBP1	Q96G27	269 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	TGM7	Q96PF1	710 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	NUDT9	Q9BW91	350 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	CHIA	Q9BZP6	476 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034		A0A1W2PR77	199 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	HMSD	A8MTL9	139 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034		A8MUA0	341 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	XKRY	O14609	159 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	HCRTR2	O43614	444 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ITGA5	P08648	1049 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	PGC	P20142	388 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	POU3F4	P49335	361 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	MAP2K6	P52564	334 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	EFNA3	P52797	238 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	DLX5	P56178	289 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ACKR1	Q16570	336 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	PRR22	Q8IZ63	422 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	SFXN2	Q96NB2	322 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RNF25-204	ENST00000473034	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	RGS11	O94810	467 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	MAOB	P27338	520 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	RAB14	P61106	215 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	RAB11B	Q15907	218 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034		Q6ZS52	159 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	MARCH3	Q86UD3	253 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	GPX8	Q8TED1	209 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RNF25-204	ENST00000473034	MYO9B	Q13459	2157 aa		13.39	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms