RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 CDHR2Q9BYE9 1310 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 HIDE1A8MVS5 230 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 ERCC8Q13216 396 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 POU2AF1Q16633 256 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 BIVMQ86UB2 503 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 PSKH2Q96QS6 385 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 CUL7Q14999 1698 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 PREX1Q8TCU6 1659 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 TRAV40A0A0B4J280 105 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 A0A1B0GVL5 298 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 ZNF208O43345 1280 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 RHOBTB1O94844 696 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 GABARAPO95166 117 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 VAMP5O95183 116 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 FABP3P05413 133 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 DCNP07585 359 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 CELP19835 753 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 TCN2P20062 427 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 CD1CP29017 333 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 RFX3P48380 749 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 ESRRGP62508 458 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 ZNF684Q5T5D7 378 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 CEP112Q8N8E3 955 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 ESR2Q92731 530 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 OR10C1Q96KK4 312 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 TMEM59Q9BXS4 323 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 AZI2Q9H6S1 392 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 NIPAL2Q9H841 368 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 PSG8Q9UQ74 426 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 ABCC2Q92887 1545 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 BICDL2A1A5D9 508 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 GOLGA8SH3BPF8 625 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 CCL21O00585 134 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 C1orf105O95561 183 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 CDKN1BP46527 198 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 CACNG7P62955 275 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 ZNF92Q03936 586 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 GINS1Q14691 196 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 COX19Q49B96 90 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 KCTD21Q4G0X4 260 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 PHYHD1Q5SRE7 291 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 KDM7AQ6ZMT4 941 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 LHFPL3Q86UP9 236 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 MYOCDQ8IZQ8 938 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 STEAP2Q8NFT2 490 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 TMEM54Q969K7 222 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 ZNRD1Q9P1U0 126 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 RFNGQ9Y644 331 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 ADAMTS12P58397 1594 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 CD109Q6YHK3 1445 aa3.48□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa3.48□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 RCBTB2O95199 551 aa3.48□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 GNAO1P09471 354 aa3.48□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 HSD17B2P37059 387 aa3.48□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 YAP1P46937 504 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 OGDHQ02218 1023 aa3.48□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 PRPSAP1Q14558 356 aa3.48□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 PDK3Q15120 406 aa3.48□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 DNAJC24Q6P3W2 148 aa3.48□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 TMEM179Q6ZVK1 233 aa3.48□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 OR1L4Q8NGR5 311 aa3.48□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 OR52P1PQ8NH57 321 aa3.48□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 NEURL3Q96EH8 262 aa3.48□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 PLEKHA8Q96JA3 519 aa3.48□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 MFFQ9GZY8 342 aa3.48□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa3.48□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 PTPRGP23470 1445 aa3.47□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa3.47□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 H0YCG3 227 aa3.47□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 ERLIN2O94905 339 aa3.47□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 MPZL1O95297 269 aa3.47□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 UTS2O95399 124 aa3.47□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 LINC00869P0C866 280 aa3.47□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.47□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 OR2A2Q6IF42 318 aa3.47□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 PMF1Q6P1K2 205 aa3.47□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 NEGR1Q7Z3B1 354 aa3.47□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 WDR86Q86TI4 376 aa3.47□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 TSGA13Q96PP4 275 aa3.47□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 FOXC2Q99958 501 aa3.47□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 ULBP2Q9BZM5 246 aa3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms