RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 MLC1Q15049 377 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 ADIPOR2Q86V24 386 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 PPP1R3BQ86XI6 285 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 GJD3Q8N144 294 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 OR56A1Q8NGH5 318 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 ELP5Q8TE02 316 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 TMEM68Q96MH6 324 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 FOXN4Q96NZ1 517 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 LAMA1P25391 3075 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 A0A0D9SG52 128 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 A0A1B0GW55 424 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 H7C1C5 153 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 CTAG2O75638 210 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 LAMP2P13473 410 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 ABOP16442 354 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 CD1CP29017 333 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 SDHAP31040 664 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 LCN6P62502 163 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 SSPNQ14714 243 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 NCMAPQ5T1S8 102 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 C3orf33Q6P1S2 294 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 KCTD9Q7L273 389 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 OR14C36Q8NHC7 312 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 ZNF285Q96NJ3 590 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 LGR4Q9BXB1 951 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 ZNF576Q9H609 170 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 PRSS16Q9NQE7 514 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 FLRT3Q9NZU0 649 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 DUX4Q9UBX2 424 aa7.23□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 C5orf52A6NGY3 159 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 LEFTY2O00292 366 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 ITGA10O75578 1167 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 DCNP07585 359 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 ITGA5P08648 1049 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 AKAIN1P0CW23 69 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 ECH1Q13011 328 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 PEA15Q15121 130 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 MISPQ8IVT2 679 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 CLEC1AQ8NC01 280 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 OR4E2Q8NGC2 313 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 OR5M8Q8NGP6 311 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 TMEM106AQ96A25 262 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 MS4A6EQ96DS6 147 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 RHOVQ96L33 236 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 SDF2Q99470 211 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 MENTQ9BUN1 341 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 ACTRT3Q9BYD9 372 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 LMAN2LQ9H0V9 348 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 CES1P1Q9UKY3 287 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 MED31Q9Y3C7 131 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 FANCMQ8IYD8 2048 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 EYSQ5T1H1 3165 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 A0A1W2PR64 198 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 A0A1W2PRV1 198 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 TVP23AA6NH52 213 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 ZNF860A6NHJ4 632 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 MSGN1A6NI15 193 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 A6NLC8 198 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 ADH1CP00326 375 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 RAB40ALP0C0E4 278 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 ABCD3P28288 659 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 RORAP35398 523 aa7.22□□□□□ -1.25
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TPM3-215ENST00000469717 ACTC1P68032 377 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 ACTA1P68133 377 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 TCEAL5Q5H9L2 206 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 SLC48A1Q6P1K1 146 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 TMEM64Q6YI46 380 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 GABRG1Q8N1C3 465 aa7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TPM3-215ENST00000469717 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.22□□□□□ -1.25
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