RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF254O75437 659 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ITGA10O75578 1167 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 STK17BO94768 372 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 GPANK1O95872 356 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PNPP00491 289 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 F12P00748 615 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 RENP00797 406 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SERPINA3P01011 423 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 IGHEP01854 428 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 HIST1H2ABP04908 130 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 OR8G3PP0DMU2 310 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 CCL3P10147 92 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 LIFP15018 202 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PLA2G5P39877 138 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 MNDAP41218 407 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 CD97P48960 835 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC16A1P53985 500 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 RAP1AP62834 184 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 CD300CQ08708 224 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC17A1Q14916 467 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 KCNMB1Q16558 191 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 BTBD16Q32M84 506 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 STPG1Q5TH74 334 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 OPN5Q6U736 354 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 DPY19L4Q7Z388 723 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PIP4P1Q86T03 277 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 RDH10Q8IZV5 341 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 POC5Q8NA72 575 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 OR6K6Q8NGW6 343 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 OR2G2Q8NGZ5 317 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 OR10AC1Q8NH08 325 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 RNF128Q8TEB7 428 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 CT55Q8WUE5 264 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 HIST1H2ACQ93077 130 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 MCHR2Q969V1 340 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 TMEM41AQ96HV5 264 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 OR14A2Q96R54 314 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ZPBPQ9BS86 351 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 TTTY10Q9BZA0 68 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 FAM117AQ9C073 453 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 RERGLQ9H628 205 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SDHAF3Q9NRP4 125 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 RASD1Q9Y272 281 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 FABP12A6NFH5 140 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC3CA6NJW4 275 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 AQP7P3A6NL99 342 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 IFITM5A6NNB3 132 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 KIR3DP1A8MWS1 328 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 CENPBD1B2RD01 187 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 C11orf98E9PRG8 122 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 AGRPO00253 132 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 TP53I11O14683 189 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 RGS5O15539 181 aa5.04□□□□□ -1.6
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