RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 OR51L1Q8NGJ5 315 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF519Q8TB69 540 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SSC4DQ8WTU2 575 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 PMEPA1Q969W9 287 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A36Q96CQ1 311 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 IMMP1LQ96LU5 166 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 FRMD6Q96NE9 622 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 INTS14Q96SY0 518 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ULBP3Q9BZM4 244 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 RNF32Q9H0A6 362 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 PTGES2Q9H7Z7 377 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 METTL7AQ9H8H3 244 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ABRACLQ9P1F3 81 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 COMMD3Q9UBI1 195 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF281Q9Y2X9 895 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 WIF1Q9Y5W5 379 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SCN2AQ99250 2005 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ITPR2Q14571 2701 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 A1L4Q6 167 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 NOTOA8MTQ0 251 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ARHGEF9O43307 516 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 OR2J2O76002 312 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 RAB40ALP0C0E4 278 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 IL7P13232 177 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ALOX5APP20292 161 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 RAB3BP20337 219 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 AHCYP23526 432 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 APEX1P27695 318 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 TALDO1P37837 337 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 FOLR3P41439 243 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 PSMD7P51665 324 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 CACNA1DQ01668 2161 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 PUDPQ08623 228 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ASAH1Q13510 395 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 DNASE1L3Q13609 305 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF79Q15937 498 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 BTBD16Q32M84 506 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 GXYLT1Q4G148 440 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 FAM69BQ5VUD6 431 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 HACD4Q5VWC8 232 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 C1QL3Q5VWW1 255 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 FDX2Q6P4F2 183 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 POMZP3Q6PJE2 187 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 FAM198BQ6UWH4 519 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 NDUFAF7Q7L592 441 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 HDDC2Q7Z4H3 204 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SNX29P2Q8IUI4 249 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 GALNT11Q8NCW6 608 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ZPLD1Q8TCW7 415 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ZNRF4Q8WWF5 429 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ZBTB8AQ96BR9 441 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 RASL10BQ96S79 203 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 KLHDC3Q9BQ90 382 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ALKBH4Q9NXW9 302 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 TEKT2Q9UIF3 430 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 LAMP5Q9UJQ1 280 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 COPS3Q9UNS2 423 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 B9D1Q9UPM9 204 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 LRBAP50851 2863 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 CENPEQ02224 2701 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1W2PNV4 684 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SHISA3A0PJX4 238 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 TTLL8A6PVC2 850 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 LRRTM2O43300 516 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SERPINI2O75830 405 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 DLGAP3O95886 979 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 HLA-DQB1P01920 261 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 RAF1P04049 648 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 UMODP07911 640 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 COX6A1P12074 109 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF28P17035 718 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 NPR2P20594 1047 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SHC1P29353 583 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 PTGDSP41222 190 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 CASP3P42574 277 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 CCR9P51686 369 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 HCCSP53701 268 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ROM1Q03395 351 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 GLO1Q04760 184 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms