RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC22A24Q8N4F4 322 aa13.44□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 NINJ1Q92982 152 aa13.44□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 Q96M85 177 aa13.44□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 DGCR6LQ9BY27 220 aa13.44□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNN2Q9H2S1 579 aa13.44□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 NELFAQ9H3P2 528 aa13.44□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF556Q9HAH1 456 aa13.44□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 ARMC1Q9NVT9 282 aa13.44□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 VNN3Q9NY84 501 aa13.44□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 NPAP1Q9NZP6 1156 aa13.44□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 AP4S1Q9Y587 144 aa13.44□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 CDH10Q9Y6N8 788 aa13.44□□□□□ -0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 PRSS37A4D1T9 235 aa13.43□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 SEC14L2O76054 403 aa13.43□□□□□ -0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 CD79AP11912 226 aa13.43□□□□□ -0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 KEAP1Q14145 624 aa13.43□□□□□ -0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 JAZF1Q86VZ6 243 aa13.43□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 CLDN22Q8N7P3 220 aa13.43□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 IL17RDQ8NFM7 739 aa13.43□□□□□ -0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 SAMD8Q96LT4 415 aa13.43□□□□□ -0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC38A2Q96QD8 506 aa13.43□□□□□ -0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 SIAEQ9HAT2 523 aa13.43□□□□□ -0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 IL20RAQ9UHF4 553 aa13.43□□□□□ -0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa13.42□□□□□ -0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 TUBA1AQ71U36 451 aa13.42□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC16A14Q7RTX9 510 aa13.42□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP13.42□□□□□ -0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 IL20Q9NYY1 176 aa13.42□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 BAIAP2Q9UQB8 552 aa13.42□□□□□ -0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PPR1 153 aa13.41□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 SOCS2O14508 198 aa13.41□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 TMCC2O75069 709 aa13.41□□□□□ -0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 RENP00797 406 aa13.41□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 IGKV3-15P01624 115 aa13.41□□□□□ -0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 CRABP1P29762 137 aa13.41□□□□□ -0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 FMODQ06828 376 aa13.41□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 NPRL3Q12980 569 aa13.41□□□□□ -0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 ATP6AP1Q15904 470 aa13.41□□□□□ -0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 MDP1Q86V88 176 aa13.41□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 SKA3Q8IX90 412 aa13.41□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF611Q8N823 705 aa13.41□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAJC9Q8WXX5 260 aa13.41□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 PIGTQ969N2 578 aa13.41□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXW5Q969U6 566 aa13.41□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 SNX18Q96RF0 628 aa13.41□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF121Q9H920 327 aa13.41□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 SEC61A2Q9H9S3 476 aa13.41□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 TBC1D23Q9NUY8 699 aa13.41□□□□□ -0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 FAIMQ9NVQ4 179 aa13.41□□□□□ -0.26
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