RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373184.5

PTPRT-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,483 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-202ENST00000373184 PAPLNO95428 1278 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 ABCD3P28288 659 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 ASAH1Q13510 395 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 IHHQ14623 411 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 MDGA2Q7Z553 956 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 LGI3Q8N145 548 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 FAM3DQ96BQ1 224 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 TM7SF3Q9NS93 570 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 PIGLQ9Y2B2 252 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 PRSS21Q9Y6M0 314 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 NUMBLQ9Y6R0 609 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 DSCR3O14972 297 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 OIP5O43482 229 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 JTBO76095 146 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 CD1EP15812 388 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 LGALS4P56470 323 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 TPBGQ13641 420 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 DOC2BQ14184 412 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 CDKN3Q16667 212 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 GDF7Q7Z4P5 450 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 HMGN2P46Q86SG4 172 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 MITD1Q8WV92 249 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 GIMAP1Q8WWP7 306 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 HAO2Q9NYQ3 351 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 T-ENOLP0DO92 83 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 GPR85P60893 370 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 SHHQ15465 462 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 STEAP3Q658P3 488 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 ZNF813Q6ZN06 617 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 NOX4Q9NPH5 578 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 APOA2P02652 100 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 NUDT7P0C024 238 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 RPL34P49207 117 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 UBE2KP61086 200 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 FCRLAQ7L513 359 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 CARFQ8N187 725 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 OR4F15Q8NGB8 312 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 GHSRQ92847 366 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 FGF21Q9NSA1 209 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 ANKRD36A6QL64 1941 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 MEIS3P2A8K0S8 358 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 IMPA2O14732 288 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 OR2F2O95006 317 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 DBHP09172 617 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 CSN1S1P47710 185 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 GABRA2P47869 451 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 TAS2R45P59539 299 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 ZP2Q05996 745 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 OR2F1Q13607 317 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 MOB3CQ70IA8 216 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 RETREG3Q86VR2 466 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 FBXO27Q8NI29 283 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 DLL4Q9NR61 685 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 PMS2P1A4D2B8 440 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 DOK2O60496 412 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 P2RX1P51575 399 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 SELENBP1Q13228 472 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 SMIM21Q3B7S5 101 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 PIGCQ92535 297 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 A0A1B0GWA3 101 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 ALOX12BO75342 701 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 HPNP05981 417 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 CLDN17P56750 224 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 ACVR1Q04771 509 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 EGR3Q06889 387 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 SAXO2Q658L1 398 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 ZNF573Q86YE8 665 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 Q8IYB0 196 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 CHST11Q9NPF2 352 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 IL20Q9NYY1 176 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 PPT2Q9UMR5 302 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 DOCK3Q8IZD9 2030 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 FIGNL2A6NMB9 653 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 ADRA2CP18825 462 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 ETV1P50549 477 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-202ENST00000373184 LIM2P55344 173 aa5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 235.5 ms