RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 CAVIN4Q5BKX8 364 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 C6orf226Q5I0X4 101 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 VAX1Q5SQQ9 334 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 TAS2R42Q7RTR8 314 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 STPG2Q8N412 459 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 C15orf56Q8N910 161 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SDR9C7Q8NEX9 313 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 UBALD1Q8TB05 177 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM54Q969K7 222 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 NT5C3BQ969T7 300 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 TPD52L3Q96J77 140 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SH3GL3Q99963 347 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC77Q9BR77 488 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00597Q9H2U6 94 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 NOX3Q9HBY0 568 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 NT5MQ9NPB1 228 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 OR12D3Q9UGF7 316 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 CIB4A0PJX0 185 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF716A6NP11 495 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 H0YIV9 168 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 L7N2F9 121 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 CACNG3O60359 315 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 ENTPD5O75356 428 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP2.21□□□□□ -2.062e-7■□□□□ 8
RABGGTB-202ENST00000370826 CTDNEP1O95476 244 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM50AO95807 157 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 C6orf47O95873 294 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF735P0CB33 412 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 CASQ1P31415 396 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 RFX3P48380 749 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 RORCP51449 518 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 CDH4P55283 916 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 PON3Q15166 354 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF493Q6ZR52 646 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 C19orf35Q6ZS72 473 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM92BQ6ZTR7 304 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 PEX26Q7Z412 305 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM135Q86UB9 458 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF561Q8N587 486 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 CEP112Q8N8E3 955 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 OR2L8Q8NGY9 312 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 OR2A5Q96R48 311 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 CRLF2Q9HC73 371 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC7A8Q9UHI5 535 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA1257Q9ULG3 409 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 KANK1Q14678 1352 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV39A0A0B4J263 110 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1B0GVX0 72 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 H0YC42 278 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 ERLIN1O75477 346 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 PRPS2P11908 318 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 PGAM1P18669 254 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 MX1P20591 662 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 KITLGP21583 273 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 GALP22466 123 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 AK4P27144 223 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 SERPINB5P36952 375 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 ACTA2P62736 377 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 ACTC1P68032 377 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 MOBPQ13875 183 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 CTSL3PQ5NE16 218 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 LY6G6FQ5SQ64 297 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM179Q6ZVK1 233 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 PGAM4Q8N0Y7 254 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 BBS5Q8N3I7 341 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 OR10G4Q8NGN3 311 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 OR5W2Q8NH69 310 aa2.2□□□□□ -2.06
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RABGGTB-202ENST00000370826 PLIN2Q99541 437 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 NDFIP1Q9BT67 221 aa2.2□□□□□ -2.06
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RABGGTB-202ENST00000370826 SCRT1Q9BWW7 348 aa2.2□□□□□ -2.06
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RABGGTB-202ENST00000370826 HYPKQ9NX55 129 aa2.2□□□□□ -2.06
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RABGGTB-202ENST00000370826 MROH5Q6ZUA9 1318 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0B4J2A0 478 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM150BA6NC51 233 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRIQ4A6NIV6 560 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 HIDE1A8MVS5 230 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 INS-IGF2F8WCM5 200 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 GOSR2O14653 212 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 PSTPIP1O43586 416 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 SOX15O60248 233 aa2.19□□□□□ -2.06
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