RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 CDAP32320 146 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 RPL4P36578 427 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 GIPRP48546 466 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ATP5J2P56134 94 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SMIM11AP58511 58 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 HGFACQ04756 655 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 MESTQ5EB52 335 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF544Q6NX49 715 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 FAM122BQ7Z309 247 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 FBXL14Q8N1E6 418 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 MUC15Q8N387 334 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 NSMAFQ92636 917 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 Q96M85 177 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 KCNS3Q9BQ31 491 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ALG12Q9BV10 488 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 CBLN4Q9NTU7 201 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 FAIMQ9NVQ4 179 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 VNN3Q9NY84 501 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 AURKCQ9UQB9 309 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ACOT8O14734 319 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGEF9O43307 516 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 OR10H3O60404 316 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 UBL3O95164 117 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 NDUFB2O95178 105 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 OR8G3PP0DMU2 310 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 CD99P14209 185 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF84P51523 738 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 RAB1AP62820 205 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 RAB39AQ14964 217 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 AGAP6Q5VW22 663 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 FAM205BPQ63HN1 556 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 VHLLQ6RSH7 139 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF584Q8IVC4 421 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 NABP1Q96AH0 204 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 RASD2Q96D21 266 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 Q96MF0 132 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 CACNG6Q9BXT2 260 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 GRIP2Q9C0E4 1043 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 DLL4Q9NR61 685 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ACANP16112 2415 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 IMPA2O14732 288 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 GYG2O15488 501 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 RAB36O95755 333 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV4-39P01824 125 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 DNAL1Q4LDG9 190 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PGBD2Q6P3X8 592 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PGM2L1Q6PCE3 622 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PRSS57Q6UWY2 283 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SLC16A14Q7RTX9 510 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 LRRC18Q8N456 261 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 OR9Q2Q8NGE9 314 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 OR4C15Q8NGM1 316 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF570Q96NI8 536 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 MAGIXQ9H6Y5 334 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SMURF2Q9HAU4 748 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 NRIP3Q9NQ35 241 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 CA10Q9NS85 328 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM64A6NGJ6 449 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM64BA6NI03 449 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 A6NIZ1 184 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 TNFRSF11BO00300 401 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 FARS2O95363 451 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 FPR3P25089 353 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 GSSP48637 474 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 RAP1BP61224 184 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 RAP1AP62834 184 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 CHRNB3Q05901 458 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ETFDHQ16134 617 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 MST1LQ2TV78 715 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 NRN1LQ496H8 165 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 THEM4Q5T1C6 240 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 KRT80Q6KB66 452 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PTCHD4Q6ZW05 846 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ADGRG5Q8IZF4 528 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 NUP37Q8NFH4 326 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 OR4F15Q8NGB8 312 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 FANK1Q8TC84 345 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 FBXO17Q96EF6 278 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 LRGUKQ96M69 825 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 RBP7Q96R05 134 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 BTBD10Q9BSF8 475 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 OR52D1Q9H346 318 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG1-201ENST00000361211 GRHPRQ9UBQ7 328 aa12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms