RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361115.4

CCL28-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL28, Length 3,126 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28-201ENST00000361115 DISC1C4P0D8 188 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 C9J4A7 227 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 REM1O75628 298 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 SLC16A8O95907 504 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 ADCYAP1P18509 176 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 ACADLP28330 430 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 IMPA1P29218 277 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 GPR1P46091 355 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 BDH1Q02338 343 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 TSPAN31Q12999 210 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 ACSM3Q53FZ2 586 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 ELFN2Q5R3F8 820 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 ACBD7Q8N6N7 88 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 CAMKVQ8NCB2 501 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 TMEM185AQ8NFB2 350 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 PRRC1Q96M27 445 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 ZNF607Q96SK3 696 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 WDR13Q9H1Z4 485 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 FN3KQ9H479 309 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 MIEF1Q9NQG6 463 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 RASL12Q9NYN1 266 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 FBXL3Q9UKT7 428 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa7□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 MASP2O00187 686 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 CTDSPLO15194 276 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 SC5DO75845 299 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 CRYBA1P05813 215 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 DCTDP32321 178 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 ACTR1BP42025 376 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 GPR4P46093 362 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 ACTR1AP61163 376 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 LRRC73Q5JTD7 316 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 OR14A16Q8NHC5 309 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 CT55Q8WUE5 264 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 WDR54Q9H977 334 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 MOKQ9UQ07 419 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 J3KRW8 73 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 GOSR2O14653 212 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 PPM1DO15297 605 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 NKX2-8O15522 239 aa6.99□□□□□ -1.29
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CCL28-201ENST00000361115 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 OMPP47874 163 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 SORDQ00796 357 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 RPE65Q16518 533 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 PGGHGQ32M88 737 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 C1orf185Q5T7R7 199 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 TMEM17Q86X19 198 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 LINC00471Q8N535 108 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 SLC37A2Q8TED4 501 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 ORAI1Q96D31 301 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 DERL3Q96Q80 235 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 JAM3Q9BX67 310 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 MFFQ9GZY8 342 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 ACACAQ13085 2346 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 DAPL1A0PJW8 107 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 TO15178 435 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 FMO6PO60774 539 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 SNAPINO95295 136 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 IFNA4P05014 189 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 ATP1B1P05026 303 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCL28-201ENST00000361115 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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