RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 GPR18Q14330 331 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 COL19A1Q14993 1142 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 COMTD1Q86VU5 262 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB34Q8NCN2 500 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR51T1Q8NGJ9 327 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR10Z1Q8NGY1 313 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR6K2Q8NGY2 324 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CDS1Q92903 461 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 BPIFA2Q96DR5 249 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ACY3Q96HD9 319 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 NPAS1Q99742 590 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CYSLTR2Q9NS75 346 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 FTSJ1Q9UET6 329 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 LCTP09848 1927 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 LRP3O75074 770 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SEMA4FO95754 770 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CST4P01036 141 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ACP5P13686 325 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GIFP27352 417 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SPCS3P61009 180 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 DUSP8Q13202 625 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SLC36A2Q495M3 483 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF684Q5T5D7 378 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF680Q8NEM1 530 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 WWTR1Q9GZV5 400 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MMP24Q9Y5R2 645 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 A6NCN8 305 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 A6NDN8 102 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PLATP00750 562 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ACSM4P0C7M7 580 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR12D1P0DN82 309 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 POU3F4P49335 361 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RPS24P62847 133 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TNFRSF17Q02223 184 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 DPTQ07507 201 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 C17orf67Q0P5P2 114 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ANGPTL5Q86XS5 388 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 BPIFB2Q8N4F0 458 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR4N2Q8NGD1 307 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SCAMP5Q8TAC9 235 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TAAR6Q96RI8 345 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 NDFIP1Q9BT67 221 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SLC39A9Q9NUM3 307 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 KCND3Q9UK17 655 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa4.53□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 HPNP05981 417 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CTRB1P17538 263 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GDNFP39905 211 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 XCR1P46094 333 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CLDN15P56746 228 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RAB38P57729 211 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RPS15P62841 145 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ERVK-25P63136 954 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 C1orf53Q5VUE5 145 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CTRB2Q6GPI1 263 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM225Q6GV28 225 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OVCH2Q7RTZ1 564 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SLC38A9Q8NBW4 561 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GJC3Q8NFK1 279 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 IL17RDQ8NFM7 739 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR4K15Q8NH41 348 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 WDR20Q8TBZ3 569 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 HS3ST2Q9Y278 367 aa4.53□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 CACNA1CQ13936 2221 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MYADML2A6NDP7 307 aa4.53□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 CTHP32929 405 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 BSGP35613 385 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 EMP3P54852 163 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ISL1P61371 349 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MPV17LQ2QL34 196 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SAXO2Q658L1 398 aa4.53□□□□□ -1.68
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